Python 读取gbff文件

Python可以使用Biopython库来读取gbff文件。gbff文件是GenBank格式的文件，包含了生物序列的信息，如DNA序列、蛋白质序列、基因注释等。

以下是使用Biopython库读取gbff文件的示例代码：

from Bio import SeqIO

# 读取gbff文件
filename = "example.gbk"
records = SeqIO.parse(filename, "genbank")

# 遍历每个记录
for record in records:
    # 输出记录的相关信息
    print("ID:", record.id)
    print("Description:", record.description)
    print("Sequence:", str(record.seq))
    print("Features:", len(record.features))

    # 遍历每个特征
    for feature in record.features:
        print("Feature type:", feature.type)
        print("Location:", feature.location)

# 关闭文件
records.close()

上述代码中，首先导入了`SeqIO`模块，然后使用`SeqIO.parse()`函数来读取gbff文件。接着，通过遍历`records`对象，可以获取每个记录的相关信息，如ID、描述、序列和特征等。最后，记得关闭文件。