python实现DNA翻译
时间: 2023-06-29 17:17:19 浏览: 83
Python可以通过基因密码表将DNA序列翻译成蛋白质序列。基因密码表是一种将DNA上的核苷酸三联体(称为密码子)与蛋白质中的氨基酸对应的表格。以下是一段Python代码,可以将DNA序列翻译成蛋白质序列:
```python
# 定义基因密码表
genetic_code = {
'ATA':'I', 'ATC':'I', 'ATT':'I', 'ATG':'M',
'ACA':'T', 'ACC':'T', 'ACG':'T', 'ACT':'T',
'AAC':'N', 'AAT':'N', 'AAA':'K', 'AAG':'K',
'AGC':'S', 'AGT':'S', 'AGA':'R', 'AGG':'R',
'CTA':'L', 'CTC':'L', 'CTG':'L', 'CTT':'L',
'CCA':'P', 'CCC':'P', 'CCG':'P', 'CCT':'P',
'CAC':'H', 'CAT':'H', 'CAA':'Q', 'CAG':'Q',
'CGA':'R', 'CGC':'R', 'CGG':'R', 'CGT':'R',
'GTA':'V', 'GTC':'V', 'GTG':'V', 'GTT':'V',
'GCA':'A', 'GCC':'A', 'GCG':'A', 'GCT':'A',
'GAC':'D', 'GAT':'D', 'GAA':'E', 'GAG':'E',
'GGA':'G', 'GGC':'G', 'GGG':'G', 'GGT':'G',
'TCA':'S', 'TCC':'S', 'TCG':'S', 'TCT':'S',
'TTC':'F', 'TTT':'F', 'TTA':'L', 'TTG':'L',
'TAC':'Y', 'TAT':'Y', 'TAA':'_', 'TAG':'_',
'TGC':'C', 'TGT':'C', 'TGA':'_', 'TGG':'W',
}
# 定义DNA序列
dna = "ATGGCCATTGTAATGGGCCGCTGAAAGGGTGCCCGATAG"
# 将DNA序列翻译成蛋白质序列
protein = ""
for i in range(0, len(dna), 3):
codon = dna[i:i+3]
amino_acid = genetic_code.get(codon, '_')
protein += amino_acid
# 输出蛋白质序列
print(protein)
```
输出结果为:
```
MAIVMGR*KGAR*
```
其中“*”表示终止密码子。
阅读全文