利用python进行图论k聚类
时间: 2023-06-16 15:04:44 浏览: 102
要使用Python进行图论k聚类,需要用到networkx和scikit-learn库。以下是一个简单的示例:
首先,导入必要的库:
```python
import networkx as nx
import numpy as np
from sklearn.cluster import KMeans
```
接下来,创建一个图。这里使用networkx库创建了一个简单的图。你可以使用不同的方法创建不同的图,具体取决于你的需求。
```python
G = nx.Graph()
G.add_edges_from([(1,2), (1,3), (2,3), (2,4), (3,4), (4,5), (5,6), (5,7), (6,7)])
```
然后,计算图中节点之间的距离。这里使用networkx库提供的最短路径算法来计算节点之间的距离。
```python
dist_matrix = np.zeros((len(G.nodes()), len(G.nodes())))
for i in range(len(G.nodes())):
for j in range(i+1, len(G.nodes())):
dist = nx.shortest_path_length(G, source=i+1, target=j+1)
dist_matrix[i][j] = dist
dist_matrix[j][i] = dist
```
接下来,使用scikit-learn库的KMeans算法来进行聚类。这里将图中的节点分成3类。
```python
kmeans = KMeans(n_clusters=3, random_state=0).fit(dist_matrix)
```
最后,将聚类结果可视化。这里使用networkx库提供的绘图功能来绘制图形,并根据聚类结果将节点分成不同的颜色。
```python
colors = ['r', 'g', 'b']
pos = nx.spring_layout(G)
for i in range(len(G.nodes())):
nx.draw_networkx_nodes(G, pos, nodelist=[i+1], node_color=colors[kmeans.labels_[i]])
nx.draw_networkx_edges(G, pos)
nx.draw_networkx_labels(G, pos)
plt.show()
```
这个示例演示了如何使用Python进行图论k聚类。当然,这只是一个简单的示例,你可以根据自己的需求进行修改和扩展。
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