运用DeepWalk对图进行嵌入并做网络重构,网络重构的结果用precision@5评价。给出python代码。
时间: 2024-03-23 11:38:54 浏览: 97
深度置信网络的Python实现例子
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以下是使用 DeepWalk 进行图嵌入和网络重构,并使用 precision@5 评价的 Python 代码:
```python
import networkx as nx
from gensim.models import Word2Vec
from sklearn.metrics.pairwise import cosine_similarity
# 加载图数据
G = nx.read_edgelist('graph.txt', nodetype=int)
# 使用 DeepWalk 进行图嵌入
model = Word2Vec(nx.random_walk.RandomWalk(G, walk_length=10, num_walks=80), size=128, window=5, min_count=0, sg=1, workers=4)
# 构建节点嵌入字典
embeddings = {}
for node in G.nodes():
embeddings[node] = model.wv[str(node)]
# 重新构建图
new_edges = []
for node in G.nodes():
sim_list = []
for other_node in G.nodes():
if node != other_node:
sim_list.append((other_node, cosine_similarity([embeddings[node]], [embeddings[other_node]])[0][0]))
sim_list = sorted(sim_list, key=lambda x: x[1], reverse=True)
new_edges.extend([(node, n) for n, _ in sim_list[:5]])
new_G = nx.Graph()
new_G.add_nodes_from(G.nodes())
new_G.add_edges_from(new_edges)
# 评价重构结果
precision_5 = 0
for node in G.nodes():
neighbors = [n for n, _ in sorted(new_G[node].items(), key=lambda x: x[1], reverse=True)[:5]]
precision_5 += len(set(neighbors) & set(G[node])) / 5.0
print("Precision@5: %.4f" % (precision_5 / len(G.nodes())))
```
在代码中,我们首先加载了图数据,然后使用 `gensim` 库中的 `Word2Vec` 模型对图进行嵌入学习。接着,我们将所有节点的嵌入向量存储到一个字典中。然后,我们对每个节点,找到与其最相似的前5个节点,并将其作为新图中该节点的邻居节点。最后,我们使用 `precision@5` 评价了重构图的效果。
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