target = target[0] seg_pred = torch.argmax(y_hat[:, 1:], dim=1) seg_acc = (seg_pred == target[:, 1]).float().mean()是什么意思
时间: 2024-04-15 12:24:09 浏览: 112
这段代码计算了分割预测的准确率(segmentation accuracy)。
首先,将目标数据`target`中的第一个层级提取出来,赋值给`target`变量。
然后,使用`torch.argmax`函数获取预测结果`y_hat`中除第一列以外的最大值所在的索引,即分割预测结果,赋值给`seg_pred`变量。
接下来,通过比较分割预测结果`seg_pred`与目标数据`target`中除第一列的对应值是否相等,得到一个布尔型张量。将布尔型张量转换为float类型,并计算其中非零值的平均值,得到准确率。
最后,将准确率值赋值给`seg_acc`变量。
这段代码用于评估分割预测的准确率,并将结果保存在`seg_acc`变量中。
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def __init__(self, mean: Sequence[Number] = None, std: Sequence[Number] = None, pad_size_divisor: int = 1, pad_value: Union[float, int] = 0, pad_mask: bool = False, mask_pad_value: int = 0, pad_seg: bool = False, seg_pad_value: int = 255, bgr_to_rgb: bool = False, rgb_to_bgr: bool = False, boxtype2tensor: bool = True, non_blocking: Optional[bool] = False, batch_augments: Optional[List[dict]] = None): super().__init__( mean=mean, std=std, pad_size_divisor=pad_size_divisor, pad_value=pad_value, bgr_to_rgb=bgr_to_rgb, rgb_to_bgr=rgb_to_bgr, non_blocking=non_blocking) if batch_augments is not None: self.batch_augments = nn.ModuleList( [MODELS.build(aug) for aug in batch_augments]) else: self.batch_augments = None self.pad_mask = pad_mask self.mask_pad_value = mask_pad_value self.pad_seg = pad_seg self.seg_pad_value = seg_pad_value self.boxtype2tensor = boxtype2tensor什么意思
这段代码是一个数据预处理器(DataPreprocessor)类的初始化方法(__init__),用于创建数据预处理器的实例。下面是对各个参数的解释:
- mean: 均值(mean)是一个数值序列,用于对图像进行均值减法。默认为 None。
- std: 标准差(std)是一个数值序列,用于对图像进行标准化处理。默认为 None。
- pad_size_divisor: pad_size_divisor 是一个整数,指定图像的尺寸除以该数的余数为 0,以便进行图像填充。默认为 1。
- pad_value: pad_value 是一个浮点数或整数,用于指定填充图像的像素值。默认为 0。
- pad_mask: pad_mask 是一个布尔值,指示是否对掩膜(mask)进行填充。默认为 False。
- mask_pad_value: mask_pad_value 是一个整数,用于指定填充掩膜的像素值。默认为 0。
- pad_seg: pad_seg 是一个布尔值,指示是否对分割图(segmentation)进行填充。默认为 False。
- seg_pad_value: seg_pad_value 是一个整数,用于指定填充分割图的像素值。默认为 255。
- bgr_to_rgb: bgr_to_rgb 是一个布尔值,指示是否将图像从 BGR 通道顺序转换为 RGB 通道顺序。默认为 False。
- rgb_to_bgr: rgb_to_bgr 是一个布尔值,指示是否将图像从 RGB 通道顺序转换为 BGR 通道顺序。默认为 False。
- boxtype2tensor: boxtype2tensor 是一个布尔值,指示是否将边界框的类型转换为张量。默认为 True。
- non_blocking: non_blocking 是一个可选的布尔值,指示是否以非阻塞方式加载数据。默认为 False。
- batch_augments: batch_augments 是一个可选的字典列表,用于定义批量增强操作。默认为 None。
在初始化方法中,首先调用父类的初始化方法(super().__init__)来设置均值、标准差、填充相关的参数和通道顺序转换的参数。然后根据传入的 batch_augments 参数,构建批量增强操作的模块列表,并将其保存到 self.batch_augments 属性中。最后,根据传入的参数设置是否进行掩膜和分割图的填充,以及是否将边界框类型转换为张量。
总之,这个初始化方法用于创建数据预处理器的实例,并设置相应的参数和属性,以便在数据预处理过程中进行图像的均值减法、标准化、填充、通道转换等操作,并支持批量增强和边界框类型转换。
解释代码ct_path = './volume-0.nii' seg_path = './segmentation-0.nii' ct_array = sitk.GetArrayFromImage(sitk.ReadImage(ct_path)) seg_array = sitk.GetArrayFromImage(sitk.ReadImage(seg_path)) seg_bg = seg_array == 0 seg_liver = seg_array >= 1 seg_tumor = seg_array == 2
这段代码的作用是读取两个医学图像文件,一个是ct图像文件(volumne-0.nii),另一个是分割图像文件(segmentation-0.nii)。然后将读取到的ct图像和分割图像转换为numpy数组(ct_array和seg_array),便于后续的图像处理和分析。接着,将分割图像分为三个部分:背景(seg_bg)、肝脏(seg_liver)和肝癌(seg_tumor),这些部分的像素值分别用0、1和2表示。
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