train_dataset = LegacyPPIDataset(mode='train') valid_dataset = LegacyPPIDataset(mode='valid') test_dataset = LegacyPPIDataset(mode='test') train_dataloader = DataLoader(train_dataset, batch_size=batch_size, collate_fn=collate) valid_dataloader = DataLoader(valid_dataset, batch_size=batch_size, collate_fn=collate) test_dataloader = DataLoader(test_dataset, batch_size=batch_size, collate_fn=collate) n_classes = train_dataset._labels.shape[1] num_feats = train_dataset.features.shape[1]

时间: 2024-04-28 17:22:20 浏览: 11
这段代码是用来加载和处理数据集的。其中`LegacyPPIDataset`是一个自定义的数据集类,用于加载PPID(Protein-Protein Interaction)数据集。`mode`参数指定了数据集的模式,可以是训练集、验证集或测试集。`DataLoader`是一个PyTorch中用于批量处理数据的工具,将数据集分成一批一批的,方便模型训练。`batch_size`参数指定了每个批次的大小。`collate`参数是一个自定义的函数,用于将数据集中的样本转换成模型可以处理的格式。`n_classes`和`num_feats`分别表示类别数和特征数量。这段代码的作用是将数据集加载到内存中,方便模型训练。
相关问题

LDAM损失函数pytorch代码如下:class LDAMLoss(nn.Module): def init(self, cls_num_list, max_m=0.5, weight=None, s=30): super(LDAMLoss, self).init() m_list = 1.0 / np.sqrt(np.sqrt(cls_num_list)) m_list = m_list * (max_m / np.max(m_list)) m_list = torch.cuda.FloatTensor(m_list) self.m_list = m_list assert s > 0 self.s = s if weight is not None: weight = torch.FloatTensor(weight).cuda() self.weight = weight self.cls_num_list = cls_num_list def forward(self, x, target): index = torch.zeros_like(x, dtype=torch.uint8) index_float = index.type(torch.cuda.FloatTensor) batch_m = torch.matmul(self.m_list[None, :], index_float.transpose(1,0)) # 0,1 batch_m = batch_m.view((16, 1)) # size=(batch_size, 1) (-1,1) x_m = x - batch_m output = torch.where(index, x_m, x) if self.weight is not None: output = output * self.weight[None, :] target = torch.flatten(target) # 将 target 转换成 1D Tensor logit = output * self.s return F.cross_entropy(logit, target, weight=self.weight) 模型部分参数如下:# 设置全局参数 model_lr = 1e-5 BATCH_SIZE = 16 EPOCHS = 50 DEVICE = torch.device('cuda:0' if torch.cuda.is_available() else 'cpu') use_amp = True use_dp = True classes = 7 resume = None CLIP_GRAD = 5.0 Best_ACC = 0 #记录最高得分 use_ema=True model_ema_decay=0.9998 start_epoch=1 seed=1 seed_everything(seed) # 数据增强 mixup mixup_fn = Mixup( mixup_alpha=0.8, cutmix_alpha=1.0, cutmix_minmax=None, prob=0.1, switch_prob=0.5, mode='batch', label_smoothing=0.1, num_classes=classes) # 读取数据集 dataset_train = datasets.ImageFolder('/home/adminis/hpy/ConvNextV2_Demo/RAF-DB/RAF/train', transform=transform) dataset_test = datasets.ImageFolder("/home/adminis/hpy/ConvNextV2_Demo/RAF-DB/RAF/valid", transform=transform_test)# 导入数据 train_loader = torch.utils.data.DataLoader(dataset_train, batch_size=BATCH_SIZE, shuffle=True,drop_last=True) test_loader = torch.utils.data.DataLoader(dataset_test, batch_size=BATCH_SIZE, shuffle=False) 帮我用pytorch实现模型在模型训练中使用LDAM损失函数

好的,以下是使用LDAM损失函数训练模型的Pytorch代码: ```python import torch import torch.nn as nn import torch.nn.functional as F import numpy as np from torchvision import datasets, transforms from ldam_loss import LDAMLoss # 定义模型 class MyModel(nn.Module): def __init__(self, num_classes): super(MyModel, self).__init__() self.num_classes = num_classes self.features = nn.Sequential( nn.Conv2d(3, 32, kernel_size=3, stride=1, padding=1), nn.BatchNorm2d(32), nn.ReLU(inplace=True), nn.MaxPool2d(kernel_size=2, stride=2), nn.Conv2d(32, 64, kernel_size=3, stride=1, padding=1), nn.BatchNorm2d(64), nn.ReLU(inplace=True), nn.MaxPool2d(kernel_size=2, stride=2), nn.Conv2d(64, 128, kernel_size=3, stride=1, padding=1), nn.BatchNorm2d(128), nn.ReLU(inplace=True), nn.MaxPool2d(kernel_size=2, stride=2), ) self.classifier = nn.Sequential( nn.Linear(128 * 4 * 4, 256), nn.ReLU(inplace=True), nn.Linear(256, num_classes), ) def forward(self, x): x = self.features(x) x = x.view(x.size(0), -1) x = self.classifier(x) return x # 设置超参数 model_lr = 1e-4 BATCH_SIZE = 16 EPOCHS = 50 DEVICE = torch.device('cuda:0' if torch.cuda.is_available() else 'cpu') use_amp = True use_dp = True classes = 7 resume = None CLIP_GRAD = 5.0 Best_ACC = 0 use_ema = True model_ema_decay = 0.9998 start_epoch = 1 seed = 1 # 设置随机种子 def seed_everything(seed): torch.manual_seed(seed) torch.cuda.manual_seed_all(seed) np.random.seed(seed) seed_everything(seed) # 定义数据增强 transform = transforms.Compose([ transforms.Resize(224), transforms.RandomHorizontalFlip(), transforms.RandomRotation(10), transforms.ToTensor(), transforms.Normalize(mean=[0.485, 0.456, 0.406], std=[0.229, 0.224, 0.225]) ]) transform_test = transforms.Compose([ transforms.Resize(224), transforms.ToTensor(), transforms.Normalize(mean=[0.485, 0.456, 0.406], std=[0.229, 0.224, 0.225]) ]) # 定义数据集 dataset_train = datasets.ImageFolder('/home/adminis/hpy/ConvNextV2_Demo/RAF-DB/RAF/train', transform=transform) dataset_test = datasets.ImageFolder("/home/adminis/hpy/ConvNextV2_Demo/RAF-DB/RAF/valid", transform=transform_test) # 定义数据加载器 train_loader = torch.utils.data.DataLoader(dataset_train, batch_size=BATCH_SIZE, shuffle=True, drop_last=True) test_loader = torch.utils.data.DataLoader(dataset_test, batch_size=BATCH_SIZE, shuffle=False) # 定义模型及优化器 model = MyModel(num_classes=classes).to(DEVICE) optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=model_lr) # 使用LDAM损失函数 cls_num_list = [dataset_train.targets.count(i) for i in range(classes)] criterion = LDAMLoss(cls_num_list=cls_num_list, max_m=0.5, weight=None, s=30) # 训练模型 for epoch in range(start_epoch, EPOCHS+1): model.train() for i, (data, target) in enumerate(train_loader): data, target = data.to(DEVICE), target.to(DEVICE) mixup_data, mixup_target = mixup_fn(data, target) # 数据增强 optimizer.zero_grad() output = model(mixup_data) loss = criterion(output, mixup_target) if use_dp: loss.backward() torch.nn.utils.clip_grad_norm_(model.parameters(), CLIP_GRAD) else: with amp.scale_loss(loss, optimizer) as scaled_loss: scaled_loss.backward() torch.nn.utils.clip_grad_norm_(amp.master_params(optimizer), CLIP_GRAD) optimizer.step() if use_ema: ema_model = ModelEMA(model, decay=model_ema_decay) ema_model.update(model) else: ema_model = None test_acc = test(model, test_loader, DEVICE) if test_acc > Best_ACC: Best_ACC = test_acc save_checkpoint({ 'epoch': epoch, 'state_dict': model.state_dict(), 'optimizer': optimizer.state_dict(), 'Best_ACC': Best_ACC, }, is_best=True) ```

LDAM损失函数pytorch代码如下:class LDAMLoss(nn.Module): def init(self, cls_num_list, max_m=0.5, weight=None, s=30): super(LDAMLoss, self).init() m_list = 1.0 / np.sqrt(np.sqrt(cls_num_list)) m_list = m_list * (max_m / np.max(m_list)) m_list = torch.cuda.FloatTensor(m_list) self.m_list = m_list assert s > 0 self.s = s if weight is not None: weight = torch.FloatTensor(weight).cuda() self.weight = weight self.cls_num_list = cls_num_list def forward(self, x, target): index = torch.zeros_like(x, dtype=torch.uint8) index_float = index.type(torch.cuda.FloatTensor) batch_m = torch.matmul(self.m_list[None, :], index_float.transpose(1,0)) # 0,1 batch_m = batch_m.view((16, 1)) # size=(batch_size, 1) (-1,1) x_m = x - batch_m output = torch.where(index, x_m, x) if self.weight is not None: output = output * self.weight[None, :] target = torch.flatten(target) # 将 target 转换成 1D Tensor logit = output * self.s return F.cross_entropy(logit, target, weight=self.weight) 模型部分参数如下:# 设置全局参数 model_lr = 1e-5 BATCH_SIZE = 16 EPOCHS = 50 DEVICE = torch.device('cuda:0' if torch.cuda.is_available() else 'cpu') use_amp = True use_dp = True classes = 7 resume = None CLIP_GRAD = 5.0 Best_ACC = 0 #记录最高得分 use_ema=True model_ema_decay=0.9998 start_epoch=1 seed=1 seed_everything(seed) # 数据增强 mixup mixup_fn = Mixup( mixup_alpha=0.8, cutmix_alpha=1.0, cutmix_minmax=None, prob=0.1, switch_prob=0.5, mode='batch', label_smoothing=0.1, num_classes=classes) # 读取数据集 dataset_train = datasets.ImageFolder('/home/adminis/hpy/ConvNextV2_Demo/RAF-DB/RAF/train', transform=transform) dataset_test = datasets.ImageFolder("/home/adminis/hpy/ConvNextV2_Demo/RAF-DB/RAF/valid", transform=transform_test) 帮我用pytorch实现模型在模型训练中使用LDAM损失函数

好的,下面是使用LDAM损失函数训练模型的代码: ```python import torch.optim as optim from torch.optim.lr_scheduler import CosineAnnealingLR from torch.utils.data import DataLoader # 定义LDAM损失函数 class LDAMLoss(nn.Module): def __init__(self, cls_num_list, max_m=0.5, weight=None, s=30): super(LDAMLoss, self).__init__() m_list = 1.0 / np.sqrt(np.sqrt(cls_num_list)) m_list = m_list * (max_m / np.max(m_list)) m_list = torch.cuda.FloatTensor(m_list) self.m_list = m_list assert s > 0 self.s = s if weight is not None: weight = torch.FloatTensor(weight).cuda() self.weight = weight self.cls_num_list = cls_num_list def forward(self, x, target): index = torch.zeros_like(x, dtype=torch.uint8) index_float = index.type(torch.cuda.FloatTensor) batch_m = torch.matmul(self.m_list[None, :], index_float.transpose(1,0)) # 0,1 batch_m = batch_m.view((x.size(0), 1)) # size=(batch_size, 1) x_m = x - batch_m output = torch.where(index, x_m, x) if self.weight is not None: output = output * self.weight[None, :] target = torch.flatten(target) # 将 target 转换成 1D Tensor logit = output * self.s return F.cross_entropy(logit, target, weight=self.weight) # 定义模型 model = models.resnet18(pretrained=True) num_ftrs = model.fc.in_features model.fc = nn.Linear(num_ftrs, classes) model.to(DEVICE) # 定义优化器和学习率调整器 optimizer = optim.Adam(model.parameters(), lr=model_lr) scheduler = CosineAnnealingLR(optimizer, T_max=EPOCHS, eta_min=1e-6) # 定义LDAM损失函数 cls_num_list = [len(dataset_train[dataset_train.targets == t]) for t in range(classes)] criterion = LDAMLoss(cls_num_list) # 定义数据加载器 train_loader = DataLoader(dataset_train, batch_size=BATCH_SIZE, shuffle=True, num_workers=4, pin_memory=True) test_loader = DataLoader(dataset_test, batch_size=BATCH_SIZE, shuffle=False, num_workers=4, pin_memory=True) # 训练模型 best_acc = 0.0 for epoch in range(start_epoch, EPOCHS + 1): model.train() train_loss = 0.0 train_corrects = 0 for inputs, labels in train_loader: inputs, labels = inputs.to(DEVICE), labels.to(DEVICE) if use_dp: inputs, labels = dp(inputs, labels) if use_amp: with amp.autocast(): inputs, labels = mixup_fn(inputs, labels) outputs = model(inputs) loss = criterion(outputs, labels) scaler.scale(loss).backward() scaler.unscale_(optimizer) torch.nn.utils.clip_grad_norm_(model.parameters(), CLIP_GRAD) scaler.step(optimizer) scaler.update() else: inputs, labels_a, labels_b, lam = mixup_fn(inputs, labels) outputs = model(inputs) loss = mixup_criterion(criterion, outputs, labels_a, labels_b, lam) loss.backward() torch.nn.utils.clip_grad_norm_(model.parameters(), CLIP_GRAD) optimizer.step() optimizer.zero_grad() train_loss += loss.item() * inputs.size(0) _, preds = torch.max(outputs, 1) train_corrects += torch.sum(preds == labels.data) train_loss /= len(dataset_train) train_acc = train_corrects.double() / len(dataset_train) model.eval() test_loss = 0.0 test_corrects = 0 with torch.no_grad(): for inputs, labels in test_loader: inputs, labels = inputs.to(DEVICE), labels.to(DEVICE) outputs = model(inputs) loss = criterion(outputs, labels) test_loss += loss.item() * inputs.size(0) _, preds = torch.max(outputs, 1) test_corrects += torch.sum(preds == labels.data) test_loss /= len(dataset_test) test_acc = test_corrects.double() / len(dataset_test) # 更新最佳模型 if test_acc > best_acc: if use_ema: ema_model.load_state_dict(model.state_dict()) best_acc = test_acc # 更新学习率 scheduler.step() # 打印训练结果 print('Epoch [{}/{}], Train Loss: {:.4f}, Train Acc: {:.4f}, Test Loss: {:.4f}, Test Acc: {:.4f}'.format( epoch, EPOCHS, train_loss, train_acc, test_loss, test_acc)) ```

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