展示一个lammps中输出的rdf文件内容

以下是一个LAMMPS中输出的RDF文件的示例内容：

# RDF from compute rdf
# N = 1000
# rbin = 0.05
# 
# C1 C2 RDF
  1  2  0.000
  1  2  0.050
  1  2  0.100
  ...
  1  2  2.350
  1  2  2.400
  1  2  2.450
  1  3  0.000
  1  3  0.050
  1  3  0.100
  ...
  1  3  2.350
  1  3  2.400

相关问题

你能给我一个lammps中rdf输出文件吗

当你在 LAMMPS 中使用 `fix rdf` 命令计算径向分布函数时，会输出一个文本文件，其中包含了不同距离范围内的配位数密度。该文件的格式为：

# LAMMPS RDF file v1.1
# TimeStep Number-of-Averages RDF-tag
1 10 c_myRDF
# r g(r)
0.0000000000000000e+00 0.0000000000000000e+00
1.0000000000000000e-01 0.0000000000000000e+00
2.0000000000000000e-01 0.0000000000000000e+00
...

其中，第一行是文件头，第二行是时间步、计算次数和 RDF 标签名，后面的数据是每个距离范围的径向分布函数值。你可以用任何文本编辑器打开该文件进行查看和分析。

lammps中rdf的数据输出文件是取一部分数据进行分析吗

在LAMMPS中，计算径向分布函数（RDF）的命令是`compute rdf`，该命令计算所有原子对之间的RDF。默认情况下，`compute rdf`命令将数据输出到一个文件中，该文件包含每个原子对之间的RDF数据。因此，该文件中包含了所有原子对的RDF数据，而不是仅仅取一部分数据进行分析。

如果你想要分析特定类型的原子对之间的RDF，可以使用`compute rdf`命令的`type`选项来指定原子类型。例如，如果你想计算Si-O原子对之间的RDF，可以使用以下命令：

compute myRDF all rdf 100
compute myRDF_SiO all rdf 100 1 2
fix myRDF all ave/time 1 10 10 c_myRDF_SiO[*] file SiO_RDF.txt mode vector

在上述命令中，`compute rdf`命令计算了所有原子对之间的RDF。然后，使用`compute rdf`命令的`type`选项来计算Si-O原子对之间的RDF。最后，使用`fix ave/time`命令将数据输出到文件`SiO_RDF.txt`中，该文件包含所有Si-O原子对之间的RDF数据。