hdf5storage.savemat存储的文件,使用matio读取时无法读取内容
时间: 2024-05-17 13:19:48 浏览: 31
可能是因为 HDF5 文件的版本不同导致的。hdf5storage.savemat 函数默认使用 HDF5 版本为 1.8.12,而 matio 只支持 HDF5 版本为 1.8.x。如果你使用了 hdf5storage.savemat 函数保存 HDF5 版本为 1.10.x 或更高版本的文件,那么 matio 将无法读取这些文件。
你可以通过将 HDF5 版本降级为 1.8.x 来解决这个问题,具体可以参考 hdf5storage 的文档。另外,你也可以尝试使用其他的 HDF5 文件读写库,如 h5py、PyTables 等。
相关问题
用python的hdf5storage保存的mat文件,无法在c++用matio读取,原因是什么
可能是因为 Python 的 hdf5storage 库和 matio 读取 mat 文件的方式不同导致的。hdf5storage 库保存的 mat 文件也是基于 HDF5 文件格式的,但是不同于 MATLAB 中的 mat 文件,因此可能会导致 matio 无法正确读取。
如果需要在 C++ 中使用 matio 读取 hdf5storage 库保存的 mat 文件,可以考虑使用 HDF5 库来读取。HDF5 库可以读取 hdf5storage 库保存的 mat 文件,因为它们都基于 HDF5 文件格式。
以下是一个使用 HDF5 库读取 mat 文件的示例代码:
```c++
#include <iostream>
#include <string>
#include <vector>
#include "hdf5.h"
int main() {
// 打开 HDF5 文件
hid_t file_id = H5Fopen("data.mat", H5F_ACC_RDONLY, H5P_DEFAULT);
if (file_id < 0) {
std::cerr << "Failed to open HDF5 file." << std::endl;
return -1;
}
// 获取MATLAB变量的名称列表
std::vector<std::string> var_names;
H5G_info_t group_info;
herr_t status = H5Gget_info(file_id, &group_info);
if (status >= 0) {
var_names.resize(group_info.nlinks);
for (unsigned int i = 0; i < group_info.nlinks; i++) {
char var_name[1024] = {0};
H5Lget_name_by_idx(file_id, ".", H5_INDEX_NAME, H5_ITER_INC, i, var_name, sizeof(var_name), H5P_DEFAULT);
var_names[i] = var_name;
}
}
// 读取变量
for (const auto& var_name : var_names) {
hid_t dataset_id = H5Dopen2(file_id, var_name.c_str(), H5P_DEFAULT);
if (dataset_id < 0) {
std::cerr << "Failed to open dataset: " << var_name << std::endl;
continue;
}
// 获取数据类型
hid_t datatype_id = H5Dget_type(dataset_id);
if (datatype_id < 0) {
std::cerr << "Failed to get datatype for dataset: " << var_name << std::endl;
H5Dclose(dataset_id);
continue;
}
// 获取数据空间
hid_t dataspace_id = H5Dget_space(dataset_id);
if (dataspace_id < 0) {
std::cerr << "Failed to get dataspace for dataset: " << var_name << std::endl;
H5Tclose(datatype_id);
H5Dclose(dataset_id);
continue;
}
// 获取数据维度
int ndims = H5Sget_simple_extent_ndims(dataspace_id);
if (ndims < 0) {
std::cerr << "Failed to get number of dimensions for dataset: " << var_name << std::endl;
H5Sclose(dataspace_id);
H5Tclose(datatype_id);
H5Dclose(dataset_id);
continue;
}
std::vector<hsize_t> dims(ndims);
H5Sget_simple_extent_dims(dataspace_id, dims.data(), NULL);
// 创建内存空间存储数据
std::vector<double> data(dims[0] * dims[1]);
hid_t mem_dataspace_id = H5Screate_simple(2, dims.data(), NULL);
// 读取数据
status = H5Dread(dataset_id, H5T_NATIVE_DOUBLE, mem_dataspace_id, dataspace_id, H5P_DEFAULT, data.data());
if (status < 0) {
std::cerr << "Failed to read dataset: " << var_name << std::endl;
} else {
std::cout << "Variable: " << var_name << std::endl;
for (int i = 0; i < dims[0]; i++) {
for (int j = 0; j < dims[1]; j++) {
std::cout << data[i * dims[1] + j] << " ";
}
std::cout << std::endl;
}
}
// 关闭数据集和数据空间
H5Sclose(mem_dataspace_id);
H5Sclose(dataspace_id);
H5Tclose(datatype_id);
H5Dclose(dataset_id);
}
// 关闭 HDF5 文件
H5Fclose(file_id);
return 0;
}
```
注意,在使用 HDF5 库读取 mat 文件时需要先打开 HDF5 文件,然后获取 MATLAB 变量的名称列表,再逐个读取变量。具体的读取操作可以参考上述示例代码。
如果以上方法仍然无法解决问题,可以考虑查看具体的报错信息或者寻求 hdf5storage 和 matio 社区的支持。
python使用hdf5storage创建mat文件
你可以使用hdf5storage模块来创建.mat文件,该模块提供了与MATLAB格式兼容的HDF5数据存储和读取功能。以下是一个简单的示例代码,可以将一个Numpy数组保存为.mat文件:
```python
import numpy as np
import hdf5storage
# 创建一个Numpy数组
data = np.array([[1, 2, 3], [4, 5, 6]])
# 将数组保存为MAT文件
hdf5storage.savemat('data.mat', {'data': data})
```
在这个示例中,我们将一个Numpy数组保存为名为"data.mat"的MAT文件。在MAT文件中,数据将作为名为"data"的变量存储。你可以使用MATLAB或任何能够读取MAT文件的程序加载这个文件,并访问其中的数据。
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