影像组学lasso特征筛选的python代码
时间: 2024-09-10 22:03:27 浏览: 102
影像组学中的LASSO(Least Absolute Shrinkage and Selection Operator)是一种常用的特征选择方法,它通过线性回归并加入L1正则化项来估计模型参数,同时使得部分系数变为零,从而达到变量选择的目的。在Python中,我们可以使用`sklearn`库的`LassoCV`函数来进行这一过程。
下面是一个简单的例子,展示如何使用`scikit-learn`对影像数据集进行LASSO特征筛选:
```python
# 导入所需库
from sklearn.linear_model import LassoCV
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
import numpy as np
# 假设你已经有了影像数据X (特征矩阵) 和标签y (目标变量)
X = ... # 影像数据,通常是numpy数组
y = ... # 目标变量,对应影像数据的标签
# 数据预处理,标准化数值特征
scaler = StandardScaler()
X_scaled = scaler.fit_transform(X)
# 创建LASSO CV对象,设置交叉验证参数
lasso = LassoCV(cv=5) # 使用5折交叉验证
# 拟合模型
lasso.fit(X_scaled, y)
# 获取特征的重要性得分(绝对值)
coefficients = lasso.coef_
# 特征选择:选取非零的系数对应的特征
selected_features = X.columns[abs(coefficients) > 0]
print("Selected features using LASSO: ", selected_features)
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