matplotlib实现PCA主特征数据和使用sklearn的PCA的结果差异,说明差异原因。
时间: 2024-05-25 20:14:23 浏览: 130
PCA(Principal Component Analysis)是一种常用的降维算法,它可以将高维数据映射到低维空间中,同时保留最重要的特征。在使用PCA时,我们通常会使用不同的库进行计算,如matplotlib和sklearn等。这两个库的实现方式可能会导致结果存在差异,下面我将说明原因。
首先,matplotlib实现PCA的过程是基于numpy库的,它主要是通过计算协方差矩阵来确定主成分,并使用numpy中的线性代数函数对数据进行转换。而sklearn中的PCA实现则采用了更加高效的SVD(Singular Value Decomposition)算法,它可以更快地计算主成分,并且可以处理稠密和稀疏数据。
其次,matplotlib和sklearn的默认参数设置也存在差异,比如在PCA的n_components参数上,matplotlib默认为None,表示保留所有主成分;而sklearn默认为1,表示只保留第一个主成分。因此,在使用这两个库时,需要注意参数设置的差异,以保证结果的一致性。
最后,由于PCA算法本身是一种随机算法,每次计算的结果可能会略有不同,因此在使用不同的库进行PCA计算时,结果的微小差异也是正常的。
综上所述,matplotlib实现PCA主要是基于numpy库的,计算方式略有不同,而sklearn则采用了更高效的SVD算法,因此两者在结果上可能存在差异。同时,由于参数设置和随机性等因素的影响,也可能导致结果存在微小差异。
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使用python完成对automobile数据集的2维主成分分析(PCA),给出原理分析和求解步骤;实现PCA编码,并用matplotlib实现PCA主特征数据显示;对比使用sklearn的PCA的结果差异,说明差异原因。
好的,关于你的问题,我可以回答。
PCA(Principal Component Analysis)是一种常见的降维方法,可以用于多维数据的可视化、聚类、分类等任务。PCA的原理是将高维数据转化成低维数据,并尽可能保留原数据的信息。
对于一个n维的数据集,其中每个数据有m个属性。PCA的求解主要包括以下几个步骤:
1. 数据标准化:对于每个属性,将其按照z-score标准化,使其均值为0,方差为1。
2. 计算协方差矩阵:协方差矩阵描述了不同属性之间的相关性,可以用公式Cov(X,Y)=E(XY)-E(X)E(Y)来计算。
3. 计算协方差矩阵的特征向量和特征值:将协方差矩阵进行特征分解,得到特征向量和特征值。
4. 选取前k个特征值对应的特征向量:按照特征值从大到小排序,选取前k个特征值对应的特征向量,这些特征向量即为新的低维空间的基向量。
5. 特征值重构:将原数据集投影到低维空间,得到新的数据集。
下面是实现PCA的代码:
```python
import numpy as np
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
import matplotlib.pyplot as plt
def my_PCA(X, k):
# 数据标准化
scaler = StandardScaler()
X_std = scaler.fit_transform(X)
# 计算协方差矩阵的特征向量和特征值
cov_mat = np.cov(X_std.T)
eig_vals, eig_vecs = np.linalg.eig(cov_mat)
# 选取前k个特征值对应的特征向量
eig_pairs = [(eig_vals[i], eig_vecs[:, i]) for i in range(len(eig_vals))]
eig_pairs.sort(reverse=True)
eig_vecs = np.array([eig_pairs[i][1] for i in range(k)])
# 特征值重构
X_new = np.dot(X_std, eig_vecs.T)
return X_new
# 加载automobile数据集
data = np.genfromtxt('Automobile.csv', delimiter=',', missing_values='?', filling_values=0, dtype=float)
# 提取数值型数据
X = data[:, :-1]
# 执行PCA
X_pca = my_PCA(X, 2)
# 绘制数据分布图
plt.scatter(X_pca[:, 0], X_pca[:, 1], s=30, c='b')
plt.xlabel('Principal Component 1')
plt.ylabel('Principal Component 2')
plt.show()
```
这段代码实现了对automobile数据集的2维PCA分析,并绘制了低维度数据的分布图。
下面是使用sklearn实现PCA的代码:
```python
from sklearn.decomposition import PCA
# 加载automobile数据集
data = np.genfromtxt('Automobile.csv', delimiter=',', missing_values='?', filling_values=0, dtype=float)
# 提取数值型数据
X = data[:, :-1]
# 使用sklearn的PCA
pca = PCA(n_components=2)
X_pca = pca.fit_transform(X)
# 绘制数据分布图
plt.scatter(X_pca[:, 0], X_pca[:, 1], s=30, c='b')
plt.xlabel('Principal Component 1')
plt.ylabel('Principal Component 2')
plt.show()
```
这段代码使用了sklearn库中的PCA模块完成了相同的任务。
两段代码的结果应该是相同的。但是,如果你对数据进行了缺失值的处理,那么两者的结果可能会有所不同。此外,两者的代码实现细节也有所不同。
2. 完成对automobile数据集的主成分分析(PCA),k维大小可自行决定。给出原理分析和求解步骤;实现PCA编码,并用matplotlib实现PCA主特征数据显示;对比使用sklearn的PCA的结果差异,说明差异原因。
这是一个技术问题,我可以帮您回答。
PCA是一种数学方法,用于数据降维和可视化。它通过线性变换将原始数据集投影到新的特征空间中,从而得到主成分。
PCA的求解步骤如下:
1. 计算数据的均值。
2. 计算协方差矩阵。
3. 对协方差矩阵进行特征值分解,得到特征值和特征向量。
4. 将特征值排序。
5. 根据保留的主成分数量,选取排序后的特征向量,组成新的特征矩阵。
6. 将原始数据通过新的特征矩阵进行变换,得到降维后的数据集。
对于这道题目,我们可以先加载automobile数据集,然后计算均值和协方差矩阵,进行特征值分解和排序,选择合适的主成分数量进行投影,最后再使用matplotlib进行可视化。
在比较自己实现的PCA和使用sklearn实现的PCA的结果差异时,可能会出现一些细微的差异,这是由于两者的实现方式和参数设置不同导致的。例如,在sklearn中可以设置n_components参数来指定需要保留的主成分数量,而自己实现的PCA需要手动调整。此外,sklearn的PCA默认使用奇异值分解(SVD)来计算主成分,而自己实现的PCA可能会使用更基本的方法。这些因素都可能会影响到结果的差异。
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