五折交叉验证时报错:Error in auc(as.numeric(test[, 1]), model_pre) : 'list' object cannot be coerced to type 'double'

时间: 2024-01-14 11:04:48 浏览: 35
这个错误通常是由于评估指标的选择或者预测结果的格式不正确导致的。请确保你使用正确的评估指标和正确的数据格式来解决这个问题。 1. 检查评估指标:在代码中,你可能使用了`auc`函数来计算AUC(Area Under the Curve),而出现了错误。这可能是因为你的评估指标应该是准确率(accuracy)而不是AUC。你可以将`scoring='accuracy'`作为参数传递给`cross_val_score`函数。 2. 检查预测结果格式:错误信息中提到了无法将一个列表('list' object)转换为浮点数类型('double')。这可能是由于预测结果的格式不正确引起的。请确保你的预测结果是一个浮点数数组或向量,而不是一个列表。 如果以上两个方面都没有问题,并且你仍然遇到同样的错误,请提供更多的相关代码和错误信息,以便我更好地帮助你解决问题。
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for(i in 1:2000){ train<- aa[ folds[[i]],] #folds[[i]]作为测试集 test <- aa[-folds[[i]],] #剩下的数据作为训练集 model<- glm(Y~maleage+HQEFR,family = binomial(link=logit), data=train) model_pre<-predict(model,type='response', newdata=test) auc_value<- append(auc_value,as.numeric(auc(as.numeric(test[,1]),model_pre))) }这段代码报错Error in auc(as.numeric(test[, 1]), model_pre) : 'list' object cannot be coerced to type 'double'

这个错误通常是由于预测结果的格式不正确导致的。在你的代码中,`test`是一个数据框(data frame),而`auc`函数要求的是一个数值型向量。 要解决这个问题,你可以将`test[, 1]`的数据类型转换为数值型向量。你可以使用`as.numeric`函数将其转换为数值型向量,并将其作为参数传递给`auc`函数。 以下是修改后的代码: ```R auc_value <- c() # 创建一个空向量来保存AUC值 for (i in 1:2000) { train <- aa[folds[[i]],] # folds[[i]]作为测试集 test <- aa[-folds[[i]],] # 剩下的数据作为训练集 model <- glm(Y ~ maleage + HQEFR, family = binomial(link = logit), data = train) model_pre <- predict(model, type = 'response', newdata = test) # 将test[, 1]转换为数值型向量 auc_value <- append(auc_value, as.numeric(auc(as.numeric(test[, 1]), model_pre))) } ``` 通过将`test[, 1]`转换为数值型向量,你应该能够解决这个错误并成功计算AUC值。请确保在运行代码之前已经加载了包含`auc`函数的相应库。如果仍然遇到问题,请提供更多的错误信息以便进一步帮助你解决问题。

./hlr_auc_gw: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open shared object file: No such file or directory

这个错误提示表明在运行`./hlr_auc_gw`命令时,系统无法找到名为`libcrypto.so.1.0.0`的共享库文件。这可能是由于缺少该库文件或者库文件路径配置不正确导致的。 要解决这个问题,你可以尝试以下几种方法: 1. 确认库文件是否存在:首先,你需要确认系统中是否存在名为`libcrypto.so.1.0.0`的共享库文件。你可以使用以下命令来搜索该文件: ```shell find / -name libcrypto.so.1.0.0 ``` 如果找到了该文件,你可以继续下一步。如果没有找到该文件,你可能需要安装或者重新配置相关的软件包。 2. 更新库文件路径:如果库文件存在,但是系统无法找到它,你可以尝试更新库文件路径。你可以使用以下命令将库文件路径添加到`LD_LIBRARY_PATH`环境变量中: ```shell export LD_LIBRARY_PATH=/path/to/library:$LD_LIBRARY_PATH ``` 其中`/path/to/library`是库文件所在的路径。然后,再次运行`./hlr_auc_gw`命令,看是否能够成功加载库文件。 3. 创建软链接:如果库文件存在,但是路径配置正确,你可以尝试创建一个软链接来解决该问题。你可以使用以下命令创建软链接: ```shell ln -s /path/to/library/libcrypto.so.1.0.0 /usr/lib/libcrypto.so.1.0.0 ``` 其中`/path/to/library`是库文件所在的路径,`/usr/lib/libcrypto.so.1.0.0`是软链接的目标路径。然后,再次运行`./hlr_auc_gw`命令,看是否能够成功加载库文件。

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修改代码,使得输出结果是可重复的:# 定义模型参数 input_dim = X_train.shape[1] epochs = 100 batch_size = 32 learning_rate = 0.01 dropout_rate = 0.7 # 定义模型结构 def create_model(): model = Sequential() model.add(Dense(64, input_dim=input_dim, activation='relu')) model.add(Dropout(dropout_rate)) model.add(Dense(32, activation='relu')) model.add(Dropout(dropout_rate)) model.add(Dense(1, activation='sigmoid')) optimizer = Adam(learning_rate=learning_rate) model.compile(loss='binary_crossentropy', optimizer=optimizer, metrics=['accuracy']) return model # 5折交叉验证 kf = KFold(n_splits=5, shuffle=True, random_state=42) cv_scores = [] for train_index, test_index in kf.split(X_train): # 划分训练集和验证集 X_train_fold, X_val_fold = X_train.iloc[train_index], X_train.iloc[test_index] y_train_fold, y_val_fold = y_train_forced_turnover_nolimited.iloc[train_index], y_train_forced_turnover_nolimited.iloc[test_index] # 创建模型 model = create_model() # 定义早停策略 #early_stopping = EarlyStopping(monitor='val_loss', patience=10, verbose=1) # 训练模型 model.fit(X_train_fold, y_train_fold, validation_data=(X_val_fold, y_val_fold), epochs=epochs, batch_size=batch_size,verbose=1) # 预测验证集 y_pred = model.predict(X_val_fold) # 计算AUC指标 auc = roc_auc_score(y_val_fold, y_pred) cv_scores.append(auc) # 输出交叉验证结果 print('CV AUC:', np.mean(cv_scores)) # 在全量数据上重新训练模型 model = create_model() model.fit(X_train, y_train_forced_turnover_nolimited, epochs=epochs, batch_size=batch_size, verbose=1) #测试集结果 test_pred = model.predict(X_test) test_auc = roc_auc_score(y_test_forced_turnover_nolimited, test_pred) test_f1_score = f1_score(y_test_forced_turnover_nolimited, np.round(test_pred)) test_accuracy = accuracy_score(y_test_forced_turnover_nolimited, np.round(test_pred)) print('Test AUC:', test_auc) print('Test F1 Score:', test_f1_score) print('Test Accuracy:', test_accuracy) #训练集结果 train_pred = model.predict(X_train) train_auc = roc_auc_score(y_train_forced_turnover_nolimited, train_pred) train_f1_score = f1_score(y_train_forced_turnover_nolimited, np.round(train_pred)) train_accuracy = accuracy_score(y_train_forced_turnover_nolimited, np.round(train_pred)) print('Train AUC:', train_auc) print('Train F1 Score:', train_f1_score) print('Train Accuracy:', train_accuracy)

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把这段代码的PCA换成LDA:LR_grid = LogisticRegression(max_iter=1000, random_state=42) LR_grid_search = GridSearchCV(LR_grid, param_grid=param_grid, cv=cvx ,scoring=scoring,n_jobs=10,verbose=0) LR_grid_search.fit(pca_X_train, train_y) estimators = [ ('lr', LR_grid_search.best_estimator_), ('svc', svc_grid_search.best_estimator_), ] clf = StackingClassifier(estimators=estimators, final_estimator=LinearSVC(C=5, random_state=42),n_jobs=10,verbose=1) clf.fit(pca_X_train, train_y) estimators = [ ('lr', LR_grid_search.best_estimator_), ('svc', svc_grid_search.best_estimator_), ] param_grid = {'final_estimator':[LogisticRegression(C=0.00001),LogisticRegression(C=0.0001), LogisticRegression(C=0.001),LogisticRegression(C=0.01), LogisticRegression(C=0.1),LogisticRegression(C=1), LogisticRegression(C=10),LogisticRegression(C=100), LogisticRegression(C=1000)]} Stacking_grid =StackingClassifier(estimators=estimators,) Stacking_grid_search = GridSearchCV(Stacking_grid, param_grid=param_grid, cv=cvx, scoring=scoring,n_jobs=10,verbose=0) Stacking_grid_search.fit(pca_X_train, train_y) Stacking_grid_search.best_estimator_ train_pre_y = cross_val_predict(Stacking_grid_search.best_estimator_, pca_X_train,train_y, cv=cvx) train_res1=get_measures_gridloo(train_y,train_pre_y) test_pre_y = Stacking_grid_search.predict(pca_X_test) test_res1=get_measures_gridloo(test_y,test_pre_y) best_pca_train_aucs.append(train_res1.loc[:,"AUC"]) best_pca_test_aucs.append(test_res1.loc[:,"AUC"]) best_pca_train_scores.append(train_res1) best_pca_test_scores.append(test_res1) train_aucs.append(np.max(best_pca_train_aucs)) test_aucs.append(best_pca_test_aucs[np.argmax(best_pca_train_aucs)].item()) train_scores.append(best_pca_train_scores[np.argmax(best_pca_train_aucs)]) test_scores.append(best_pca_test_scores[np.argmax(best_pca_train_aucs)]) pca_comp.append(n_components[np.argmax(best_pca_train_aucs)]) print("n_components:") print(n_components[np.argmax(best_pca_train_aucs)])

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