Pymol label氨基酸残基
时间: 2023-10-21 18:21:33 浏览: 86
在Pymol中,可以使用label命令来标记氨基酸残基。首先,您需要选择要标记的交互氨基酸残基的label。然后,在配体的Label下找到residues,并将其标记出来。接下来,在Label下的clear选项下清除其他标记。这样,您就可以标记出氨基酸残基了。<span class="em">1</span><span class="em">2</span><span class="em">3</span>
#### 引用[.reference_title]
- *1* *2* *3* [pymol 分离蛋白与小分子保存;pymol分离蛋白多聚体亚基;pymol对接位点交互图展示;去除杂原子](https://blog.csdn.net/weixin_42357472/article/details/127772501)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_1"}}] [.reference_item style="max-width: 100%"]
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相关问题
pymol label置于顶层
在PyMOL中,可以使用`label`命令将标签置于顶层。通过设置标签的`position`参数为`top`,可以将标签放置在分子的顶部。
以下是一个示例代码:
```python
# 将标签置于顶层
label top, name CA
```
上述代码将在分子的顶部添加一个标签,标签内容为`name CA`。
pymol 注释 7cyp
要在 PyMOL 中注释 7cyp 蛋白质分子的话,可以按照以下步骤进行:
1. 打开 PyMOL 软件,点击 "File" -> "Open" 并选择 7cyp 的 PDB 文件。
2. 在 PyMOL 的命令行中输入 "show cartoon",以便以漫画形式展示蛋白质分子。
3. 使用 "create" 命令创建一个新的对象,例如 "create Ligand, resn HEM",这将创建一个名为 "Ligand" 的对象,其中包含 PDB 文件中残基名称为 "HEM" 的配体。
4. 使用 "zoom" 命令调整视角,以便更好地看到配体和蛋白质分子。
5. 在 PyMOL 工具栏中选择 "Label" 工具,并在蛋白质分子或配体上单击鼠标右键,选择 "Label"。
6. 在 "Label" 窗口中输入要注释的文本,例如 "HEM 配体",并选择要显示的字体和颜色。
7. 单击 "OK" 保存注释。
这样就可以在 PyMOL 中注释 7cyp 蛋白质分子了。