summary plot

时间: 2023-10-23 17:36:31 浏览: 54
在机器学习中,Summary Plot是一种图表,用于展示特征重要性和特征效果的综合信息。它将每个样本的每个特征的Shapley值绘制在图表上,其中y轴表示特征,x轴表示Shapley值。通过颜色的变化来表示特征值的大小,红色代表高值,蓝色代表低值。通常,Summary Plot会根据特征的重要性进行排序,以便更好地理解每个特征对预测的影响。此外,为了避免点的重叠,Summary Plot还会在y轴方向进行微小抖动。通过观察Summary Plot,我们可以得出每个特征的Shapley值分布以及它们的重要性。
相关问题

shap.summary_plot分析示例

当使用shap.summary_plot进行分析时,我们可以以一个示例来说明。假设我们正在使用一个二元分类模型来预测房屋是否被购买,而我们的数据集包含房屋的各种特征,如面积、位置、房龄等。 首先,我们可以调用shap.summary_plot来生成特征重要性的直方图,代码如下: ```python import shap shap.initjs() # 计算SHAP值 explainer = shap.Explainer(model, X_train) shap_values = explainer.shap_values(X_test) # 绘制特征重要性图表 shap.summary_plot(shap_values, X_test, feature_names=X_test.columns) ``` 生成的图表将显示每个特征的SHAP值,以及平均SHAP值的竖线。假设我们得到了以下图表: ![shap_summary_plot_example](https://shap.readthedocs.io/en/latest/_images/shap_summary_plot_example.png) 根据图表的观察,我们可以得出以下结论: - 特征"面积"(Area)对预测结果的贡献最大,其SHAP值最高。这意味着面积较大的房屋更有可能被购买。 - 特征"位置"(Location)和"房龄"(Age)的SHAP值接近于0,说明它们对预测结果的影响较小。 - 特征"卧室数量"(Bedrooms)和"浴室数量"(Bathrooms)对预测结果的影响也较小,但是"浴室数量"的SHAP值稍高于"卧室数量"。 - 其他特征的贡献也可以通过观察相应的SHAP值来判断。 通过shap.summary_plot的分析,我们可以了解各个特征对预测结果的相对重要性,并根据这些信息进行进一步的解释和决策。

shap.summary_plot 保存至特定excel

可以使用 pandas 库中的 DataFrame.to_excel() 方法将 shap.summary_plot() 的结果保存至特定的 Excel 文件中。具体操作可以参考以下代码: ```python import pandas as pd import shap # 生成 shap.summary_plot() 的结果 explainer = shap.Explainer(model, X_train) shap_values = explainer(X_test) summary_plot = shap.summary_plot(shap_values, X_test) # 将结果保存至特定的 Excel 文件中 df = pd.DataFrame(summary_plot) df.to_excel('path/to/excel/file.xlsx', index=False) ``` 其中,`model` 是你训练好的模型,`X_train` 和 `X_test` 分别是训练集和测试集的特征数据。`path/to/excel/file.xlsx` 是你想要保存的 Excel 文件的路径和文件名。

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import shap explainer = shap.TreeExplainer(reg) shap_values = explainer.shap_values(X_wrapper) shap.summary_plot(shap_values, X_wrapper,show=False) plt.title('SHAP Summary Plot') plt.xlabel('SHAP Value') plt.ylabel('Feature') plt.tight_layout() plt.savefig('E:/exercise/Nano/fig/shap_bay.pdf'),运行这段代码结果报错“initialization of _internal failed without raising an exception”,这个错误通常是由于Shap库的版本不兼容或缺少依赖项导致的。要解决这个问题,按照以上步骤操作后仍然报错“ERROR: Could not install packages due to an OSError: [WinError 5] 拒绝访问。: 'G:\\Anaconda\\Lib\\site-packages\\~~mpy\\.libs\\libopenblas64__v0.3.21-gcc_10_3_0.dll' Consider using the --user option or check the permissions. Requirement already satisfied: shap in g:\anaconda\lib\site-packages (0.42.1) Requirement already satisfied: scikit-learn in g:\anaconda\lib\site-packages (from shap) (0.24.2) Requirement already satisfied: numba in g:\anaconda\lib\site-packages (from shap) (0.54.1) Requirement already satisfied: scipy in g:\anaconda\lib\site-packages (from shap) (1.7.1) Requirement already satisfied: numpy in g:\anaconda\lib\site-packages (from shap) (1.24.4) Requirement already satisfied: tqdm>=4.27.0 in g:\anaconda\lib\site-packages (from shap) (4.62.3) Requirement already satisfied: packaging>20.9 in g:\anaconda\lib\site-packages (from shap) (21.0) Requirement already satisfied: cloudpickle in g:\anaconda\lib\site-packages (from shap) (2.0.0) Requirement already satisfied: slicer==0.0.7 in g:\anaconda\lib\site-packages (from shap) (0.0.7) Requirement already satisfied: pandas in g:\anaconda\lib\site-packages (from shap) (1.3.4) Requirement already satisfied: pyparsing>=2.0.2 in g:\anaconda\lib\site-packages (from packaging>20.9->shap) (3.0.4) Requirement already satisfied: colorama in g:\anaconda\lib\site-packages (from tqdm>=4.27.0->shap) (0.4.6) Collecting numpy Downloading numpy-1.20.3-cp39-cp39-win_amd64.whl (13.7 MB) Requirement already satisfied: setuptools in g:\anaconda\lib\site-packages (from numba->shap) (58.0.4) Requirement already satisfied: llvmlite<0.38,>=0.37.0rc1 in g:\anaconda\lib\site-packages (from numba->shap) (0.37.0) Requirement already satisfied: pytz>=2017.3 in g:\anaconda\lib\site-packages (from pandas->shap) (2021.3) Requirement already satisfied: python-dateutil>=2.7.3 in g:\anaconda\lib\site-packages (from pandas->shap) (2.8.2) Requirement already satisfied: six>=1.5 in g:\anaconda\lib\site-packages (from python-dateutil>=2.7.3->pandas->shap) (1.16.0) Requirement already satisfied: threadpoolctl>=2.0.0 in g:\anaconda\lib\site-packages (from scikit-learn->shap) (2.2.0) Requirement already satisfied: joblib>=0.11 in g:\anaconda\lib\site-packages (from scikit-learn->shap) (1.1.0) Installing collected packages: numpy Attempting uninstall: numpy Found existing installation: numpy 1.24.4 Uninstalling numpy-1.24.4: Successfully uninstalled numpy-1.24.4”,应该如何解决?

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