通过conda和源代码两种方式安装bedtk,bedtk源代码地址:https://github.com/lh3/bedtk,运行编译后的bedtk程序
时间: 2023-12-07 19:05:23 浏览: 146
PIP和conda 更换国内安装源的方法步骤
好的,下面是分别通过conda和源代码两种方式安装bedtk并运行编译后的bedtk程序的步骤:
## 通过conda安装bedtk
1. 打开终端或命令行窗口,输入以下命令更新conda:
```
conda update conda
```
2. 创建一个新的conda环境,并安装bedtk:
```
conda create -n bedtk-env
conda activate bedtk-env
conda install -c bioconda bedtk
```
3. 激活conda环境并测试bedtk是否安装成功:
```
bedtk --help
```
## 通过源代码安装bedtk
1. 打开终端或命令行窗口,安装编译bedtk所需的依赖项:
```
sudo apt-get update
sudo apt-get install -y gcc make zlib1g-dev
```
2. 下载bedtk源代码:
```
git clone https://github.com/lh3/bedtk.git
```
3. 进入bedtk目录,编译bedtk程序:
```
cd bedtk
make
```
4. 测试bedtk是否编译成功:
```
./bedtk --help
```
希望这些步骤能够帮助您安装并运行bedtk程序。
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