mic相关性分析python代码
时间: 2023-09-21 12:10:47 浏览: 328
下面是一个使用Python进行MIC(最大信息系数)相关性分析的示例代码:
```python
import pandas as pd
import minepy
# 读取数据
data = pd.read_csv('data.csv')
# 计算MIC
mic = minepy.MINE(alpha=0.6, c=15)
mic_scores = []
for column in data.columns:
mic_score = mic.compute_score(data[column], data['target'])
mic_scores.append(mic_score)
# 打印结果
result = pd.DataFrame({'feature': data.columns, 'MIC': mic_scores})
print(result.sort_values('MIC', ascending=False))
```
代码中使用了`pandas`和`minepy`库,需要先安装这两个库。其中`data.csv`是需要分析的数据文件,`target`是目标变量列名。MIC的计算使用了`minepy.MINE`类,可以通过`alpha`和`c`参数调整MIC的敏感度。最终结果会按照MIC的大小排序并输出。
相关问题
mic算法 python
mic算法是一种用于计算变量之间的相关性的统计方法,在Python中可以使用相关的库和函数来实现。
首先,可以使用pandas库来加载需要计算的数据集。可以使用read_csv函数将数据从csv文件中读取到一个DataFrame对象中。
接下来,使用minepy库中的MIC函数来计算mic值。MIC函数的参数是一个numpy数组,它表示数据集中的所有变量,可以使用DataFrame的values属性来获取。
然后,将数据传递给MIC函数,并将结果保存在一个变量中。MIC函数的返回值是一个包含mic值和证据矩阵的元组。
最后,可以将结果打印出来,或者将它保存到一个文件中,以备后续分析使用。
下面是一个示例代码:
```python
import pandas as pd
from minepy import MINE
# 加载数据
data = pd.read_csv("data.csv")
# 提取变量
variables = data.values
# 计算mic值
mic = MINE()
mic_values = []
for i in range(variables.shape[1]):
for j in range(variables.shape[1]):
x = variables[:, i]
y = variables[:, j]
mic.compute_score(x, y)
mic_values.append((i, j, mic.mic()))
# 打印结果
for i, j, value in mic_values:
print(f"变量{i}和变量{j}的mic值为:{value}")
```
这样,就可以使用Python中的mic算法来计算给定数据集中的变量之间的相关性。
阅读全文