密度聚类流程及原理,并用python写一段密度聚类代码
时间: 2023-08-01 22:15:28 浏览: 88
密度聚类dbscan算法—python代码实现(含二维三维案例、截图、说明手册等)
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密度聚类(Density-based clustering)是一种基于密度的聚类算法,它将数据点组织成簇的方式是通过寻找数据点周围的密度高于某个阈值的区域。密度聚类的核心是密度可达性,即如果一个点A在另一个点B的密度半径内,则A可以到达B。密度聚类相比于传统的聚类算法(如K-Means、层次聚类等)更加灵活,可以处理不同形状和密度的簇。
密度聚类的流程如下:
1. 选择一个密度半径r和一个最小的密度n,n表示在密度半径r内至少有n个数据点才能形成一个簇。
2. 随机选择一个未被访问的数据点p,找到p的密度半径r内的所有数据点。
3. 如果p的密度大于等于n,则将p标记为核心点,并将p的密度半径内的所有数据点加入到p的簇中。
4. 如果p的密度小于n,则将p标记为噪声点。
5. 重复2-4直到所有的数据点都被访问过。
6. 将所有被标记为核心点的数据点组成簇,将噪声点排除掉。
下面是Python实现密度聚类的代码:
```python
import numpy as np
from sklearn.neighbors import NearestNeighbors
class DensityCluster:
def __init__(self, radius=1.0, min_samples=5):
self.radius = radius
self.min_samples = min_samples
self.labels_ = None
def fit(self, X):
nbrs = NearestNeighbors(radius=self.radius, min_samples=self.min_samples).fit(X)
self.labels_ = np.zeros(X.shape[0])
cluster_id = 1
for i, point in enumerate(X):
if self.labels_[i] != 0:
continue
neighbors = nbrs.radius_neighbors([point])[1][0]
if len(neighbors) < self.min_samples:
self.labels_[i] = -1
else:
self.labels_[neighbors] = cluster_id
while len(neighbors) > 0:
new_neighbors = []
for j in neighbors:
if self.labels_[j] == -1:
self.labels_[j] = cluster_id
elif self.labels_[j] == 0:
self.labels_[j] = cluster_id
new_neighbors += nbrs.radius_neighbors([X[j]], radius=self.radius, return_distance=False)[0].tolist()
neighbors = new_neighbors
cluster_id += 1
return self.labels_
```
以上代码实现了带有核心点和噪声点的密度聚类算法。其中,radius和min_samples是密度聚类算法的两个超参数。如果一个数据点在radius半径内至少有min_samples个数据点,则它是一个核心点;如果一个数据点在radius半径内少于min_samples个数据点,则它是一个噪声点。
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