CHB-MIT儿童癫痫数据集,对数据集进行简单滤波归一化,然后传入图卷积神经网络进行训练的每一个步骤的详细代码
时间: 2024-12-22 21:18:55 浏览: 7
癫痫脑电分类实例:基于美国儿童医院CHB-MIT数据集的一维卷积神经网络的训练实例
4星 · 用户满意度95%
CHB-MIT儿童癫痫数据集是一个常用于研究医学图像分析,尤其是癫痫检测的研究数据集,包含了脑电图(EEG)信号和相关的临床信息。对于此类数据预处理、滤波归一化以及图卷积神经网络(GCN)训练,以下是Python环境下Pandas、NumPy、MNE-Python(用于 EEG 数据处理)和Keras(用于构建GCN模型)的一个简化示例:
```python
# 导入所需库
import numpy as np
import pandas as pd
from mne.io import read_raw_edf
from scipy.signal import butterworth, lfilter
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
from tensorflow.keras.models import Model
from tensorflow.keras.layers import Input, Conv1D
# 加载数据集
data_path = 'CHB-MIT_data_directory' # 替换为实际路径
raw_files = ['file1.edf', 'file2.edf'] # 根据实际情况替换
df = pd.DataFrame({'filename': raw_files}) # 假设每个文件对应一行
# 预处理步骤
def preprocess(file):
raw = read_raw_edf(file)
raw.filter(1, 40, method='iir') # 进行低通滤波,去除高频噪声
raw.resample(sfreq=256) # 调整采样率
data = raw.get_data() # 提取数据
return data
df['processed_data'] = df['filename'].apply(preprocess)
# 滤波归一化
scaler = StandardScaler()
df['normalized_data'] = scaler.fit_transform(df['processed_data'])
# 构建图卷积层
input_shape = df['normalized_data'].iloc[0].shape[1:]
gc_layer = Conv1D(filters=32, kernel_size=7, activation='relu') # 示例图卷积层
# 使用GCN层
inputs = Input(shape=input_shape)
x = gc_layer(inputs)
output = x
model = Model(inputs=inputs, outputs=output)
# 编译模型
model.compile(optimizer='adam', loss='binary_crossentropy', metrics=['accuracy'])
# 训练模型
history = model.fit(df['normalized_data'], labels, epochs=10, batch_size=32) # 'labels'是对应的数据标签
阅读全文