h_dst = h[str(edge_type)][block.dstdata[dgl.NID]]
时间: 2023-06-25 13:02:45 浏览: 65
这行代码是使用字符串类型的 edge_type 作为字典 h 的键,获取目标节点的特征向量。具体来说,block 是一个 DGL 的子图对象,它包含了当前处理的这一层图中的所有节点和边。block.dstdata[dgl.NID] 返回当前子图中所有目标节点的 ID,这些 ID 会被用作字典 h 的键的索引。因此,h[str(edge_type)][block.dstdata[dgl.NID]] 返回了一个形状为 (num_dst_nodes, hidden_size) 的张量,表示当前处理的这一层图中所有目标节点的特征向量。
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class GraphSAGE(nn.Module): def __init__(self, in_feats, hidden_feats, out_feats, num_layers, activation): super(GraphSAGE, self).__init__() self.num_layers = num_layers self.conv1 = SAGEConv(in_feats, hidden_feats, aggregator_type='mean') self.convs = nn.ModuleList() for i in range(num_layers - 2): self.convs.append(SAGEConv(hidden_feats, hidden_feats, aggregator_type='mean')) self.conv_last = SAGEConv(hidden_feats, out_feats, aggregator_type='mean') self.activation = activation def forward(self, blocks, x): h = x for i, block in enumerate(blocks): h_dst = h[:block.number_of_dst_nodes()] h = self.convs[i](block, (h, h_dst)) if i != self.num_layers - 2: h = self.activation(h) h = self.conv_last(blocks[-1], (h, h_dst)) return h改写一下,让它适用于异质图
class GraphSAGE(nn.Module):
def __init__(self, in_feats, hidden_feats, out_feats, num_layers, activation):
super(GraphSAGE, self).__init__()
self.num_layers = num_layers
self.conv1 = SAGEConv(in_feats, hidden_feats, aggregator_type='mean')
self.convs = nn.ModuleList()
for i in range(num_layers - 2):
self.convs.append(SAGEConv(hidden_feats, hidden_feats, aggregator_type='mean'))
self.conv_last = SAGEConv(hidden_feats, out_feats, aggregator_type='mean')
self.activation = activation
def forward(self, blocks, x_dict):
h = {k: v for k, v in x_dict.items()}
for i, block in enumerate(blocks):
edge_type = block.edata['type']
h_dst = h[str(edge_type)][block.dstdata[dgl.NID]]
h = self.convs[i](block, (h, h_dst))
if i != self.num_layers - 2:
h = self.activation(h)
h_dst = h[str(edge_type)][blocks[-1].dstdata[dgl.NID]]
h = self.conv_last(blocks[-1], (h, h_dst))
return h
解释一下这段代码,并每一句给出注释:def db_scan_new(mkpts, min_samples=5, max_dst=40): # min_samples = 6 # round(len(mkpt1) * 0.8) # max_dst = 40 # maximum distance between two samples db = DBSCAN(eps=max_dst, min_samples=min_samples).fit(mkpts) labels = db.labels_ # Number of clusters in labels, ignoring noise if present. n_clusters_ = len(set(labels)) - (1 if -1 in labels else 0) n_noise_ = list(labels).count(-1) if n_clusters_ < 1: return None filtered_labels = [x for x in labels if x != -1] unique, counts = np.unique(filtered_labels, return_counts=True) T = 0.2 all_idxs = [] for lbl_idx in np.argsort(counts)[::-1]: if counts[lbl_idx] / counts.max() >= T: idxs = np.argwhere(filtered_labels == lbl_idx).flatten() all_idxs.extend(idxs) all_idxs = np.array(sorted(all_idxs)) dense_mkpts = mkpts[all_idxs] return dense_mkpts
这段代码实现了基于 DBSCAN 算法的密集聚类。以下是每句代码的注释:
```python
def db_scan_new(mkpts, min_samples=5, max_dst=40):
# 定义函数 db_scan_new,该函数接受一个名为 mkpts 的参数,
# 以及两个可选参数 min_samples 和 max_dst,它们分别代表最小样本数和最大距离阈值。
# 默认情况下,min_samples 为 5,max_dst 为 40。
db = DBSCAN(eps=max_dst, min_samples=min_samples).fit(mkpts)
# 使用 DBSCAN 算法进行聚类,其中 eps 参数设置为 max_dst,min_samples 参数设置为 min_samples。
# 将算法应用于 mkpts 数据集,并将结果存储在 db 变量中。
labels = db.labels_
# 获取每个点的聚类标签,存储在 labels 变量中。
n_clusters_ = len(set(labels)) - (1 if -1 in labels else 0)
# 获取聚类数量,但会忽略噪声点(标签为 -1)。
n_noise_ = list(labels).count(-1)
# 获取噪声点数量。
if n_clusters_ < 1:
return None
# 如果聚类数量小于 1,即没有聚类,则返回 None。
filtered_labels = [x for x in labels if x != -1]
# 过滤掉噪声点,得到所有非噪声点的聚类标签。
unique, counts = np.unique(filtered_labels, return_counts=True)
# 统计每个聚类中的点数。
T = 0.2
# 设置一个阈值,用于过滤掉点数过少的聚类。
all_idxs = []
# 存储所有密集聚类的点的索引。
for lbl_idx in np.argsort(counts)[::-1]:
if counts[lbl_idx] / counts.max() >= T:
# 如果该聚类的点数占所有聚类点数的比例大于等于阈值,则将该聚类的点的索引加入 all_idxs。
idxs = np.argwhere(filtered_labels == lbl_idx).flatten()
all_idxs.extend(idxs)
all_idxs = np.array(sorted(all_idxs))
# 对所有密集聚类的点的索引进行排序。
dense_mkpts = mkpts[all_idxs]
# 根据索引获取所有密集聚类的点。
return dense_mkpts
# 返回所有密集聚类的点作为结果。
```