repeatmasker和RepeatModeler相较于edta方法是否占用的运行内存会更小

时间: 2024-05-21 22:17:45 浏览: 175

两种重写方法的内存机制

在编程语言如C#中，`new`和`override`关键字用于处理类的继承和方法重写，这两种机制涉及到内存管理和多态性。本文将详细解释这两种重写方法的内存机制，并通过实例来阐述它们的区别。让我们回顾一下继承实例化的流程。当创建一个子类对象时，如`Student`实例，内存会执行以下操作： 1. **实例化父类成员**：在子类对象的内存空间中，会为父类的所有公有成员分配空间。在这个例子中，`Person`类有`name`字符串变量，`age`整型变量初始化为10，以及两个非虚方法`printC()`和`printD()`，还有一个虚方法`printA()`。 2. **实例化子类成员**：接着，为子类特有的成员分配空间。在`Student`类中，除了继承的成员外，还有`num`整型变量，以及对`printA()`的重写和`printD()`的`new`重写。 3. **基类引用**：子类对象内部包含一个指向父类实例的引用，这在C#中称为`base`，在Java中为`super`。这意味着子类对象可以访问并调用父类的成员。现在，我们来看看`new`和`override`重写的关键区别： **1. `new`重写**： - 当子类使用`new`关键字重写父类方法时，它并不改变父类原有的方法，而是创建一个新的同名方法。在`Student`类中，`new`重写了`printD()`，这意味着`Student`对象有一个属于自己的`printD()`方法。 - 当使用子类引用`stu`调用`printD()`时，会执行子类的实现。但若将子类对象转换为父类引用`person pe = (person)stu`，调用`pe.printD()`则会执行父类中的`printD()`方法，因为子类的`new`重写并不影响父类引用的可见性。 **2. `override`重写**： - `override`关键字允许子类覆盖父类的虚方法。在`Student`类中，`printA()`被`override`重写，这意味着它会替换父类的实现。 - 不论是使用子类引用`stu`还是父类引用`pe`调用`printA()`，都会执行子类中的`printA()`实现，因为`override`重写真正地覆盖了父类的方法。无论通过哪种引用调用，多态性保证了始终调用子类的覆盖版本。总结起来，`new`关键字主要用于隐藏父类的方法，而不是覆盖。它在子类对象中创建了一个新的同名方法，但不会影响父类引用的行为。而`override`关键字则真正实现了方法的覆盖，不论通过何种引用调用，都会执行子类的覆盖版本，体现了多态性。理解这两种重写方式对于理解和优化面向对象程序设计至关重要。

RepeatMasker和RepeatModeler在运行时会占用较少的内存，相对于EDTA方法来说。这是因为RepeatMasker和RepeatModeler基于BLAST和HMMER等算法实现，这些算法在内存管理方面相对较好，能够高效地利用计算机的内存资源。而EDTA方法则是基于比对和图形遍历算法，需要消耗更多的内存来存储比对和图形遍历的结果。因此，如果你的计算机内存资源较为有限，建议使用RepeatMasker和RepeatModeler这两种算法来进行重复序列分析。

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