python 读取csv文件 k-medoide算法 轮廓系数 可视化
时间: 2023-07-18 09:13:55 浏览: 100
以下是Python读取CSV文件并使用k-medoids算法计算轮廓系数并进行可视化的示例代码:
```python
import pandas as pd
from sklearn_extra.cluster import KMedoids
from sklearn.metrics import silhouette_score
import matplotlib.pyplot as plt
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
# 读取CSV文件
data = pd.read_csv('data.csv')
# 获取特征列
X = data.iloc[:, :-1].values
# 选择簇数k
k = 3
# 使用k-medoids算法进行聚类
kmedoids = KMedoids(n_clusters=k, random_state=0).fit(X)
# 计算轮廓系数
labels = kmedoids.labels_
silhouette_avg = silhouette_score(X, labels)
print("簇数为%d时的轮廓系数为%f" % (k, silhouette_avg))
# 可视化聚类结果
fig = plt.figure()
ax = Axes3D(fig)
colors = ['r', 'g', 'b']
for i in range(k):
ax.scatter(X[labels == i, 0], X[labels == i, 1], X[labels == i, 2], c=colors[i])
ax.set_xlabel('X Label')
ax.set_ylabel('Y Label')
ax.set_zlabel('Z Label')
plt.show()
```
其中,`data.csv`是要读取的CSV文件,第一列至倒数第二列是特征列,最后一列是标签列。首先通过`pd.read_csv()`函数读取CSV文件,然后使用`.iloc[:, :-1].values`获取特征列数据,最后使用`KMedoids`函数进行聚类,计算轮廓系数使用`silhouette_score`函数。
接着,使用`Axes3D`创建3D坐标轴,并根据聚类结果将数据点可视化。其中,`colors`数组存储不同簇的颜色。最后使用`plt.show()`显示可视化结果。
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