R语言用shap解释随机森林回归模型
时间: 2023-07-16 22:11:48 浏览: 1698
在R语言中,可以使用“randomForest”包来构建随机森林回归模型,使用“shap”包来解释模型的预测结果。
首先,加载所需的包:
``` r
library(randomForest)
library(shap)
```
接下来,我们使用一个示例数据集“BostonHousing”,它包含了波士顿地区房屋的各种特征和价格。
``` r
data(BostonHousing)
```
然后,我们将数据集划分为训练集和测试集:
``` r
set.seed(123)
train_index <- sample(1:nrow(BostonHousing), 0.7*nrow(BostonHousing))
train_data <- BostonHousing[train_index,]
test_data <- BostonHousing[-train_index,]
```
接下来,我们使用“randomForest”包来构建随机森林回归模型,并使用测试集来评估模型的性能:
``` r
rf_model <- randomForest(medv ~ ., data = train_data, ntree = 100, importance = TRUE)
rf_pred <- predict(rf_model, test_data)
rf_rmse <- sqrt(mean((rf_pred - test_data$medv)^2))
rf_rmse
```
最后,我们使用“shap”包来解释模型的预测结果。首先,我们需要使用“shap_values”函数来计算每个特征对预测结果的贡献:
``` r
shap_values <- shap_values(rf_model, x = test_data[,-14])
```
然后,我们可以使用“summary_plot”函数来绘制每个特征的SHAP值的柱状图:
``` r
summary_plot(shap_values, test_data[,-14])
```
此外,我们还可以使用“force_plot”函数来绘制单个样本的SHAP值的力导图,以更详细地了解特定样本的预测结果如何受到每个特征的影响:
``` r
force_plot(shap_values, test_data[1,-14])
```
这些函数可以帮助我们更好地理解随机森林回归模型的预测结果,并确定哪些特征对预测结果的贡献最大。
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