举个MCMC采样的例子
时间: 2023-08-12 10:45:24 浏览: 89
假设我们想从一个复杂的分布中采样,例如高斯混合模型。在这种情况下,我们可以使用MCMC算法来采样。
具体地,我们可以使用Metropolis-Hastings算法来实现MCMC采样。该算法包括以下步骤:
1. 随机初始化一个状态,例如从某个简单分布中采样得到。
2. 从当前状态出发,根据一个提议分布生成一个候选状态。
3. 计算接受概率,即由当前状态转移到候选状态的概率与由候选状态转移到当前状态的概率之比。如果接受概率大于等于1,直接接受候选状态;否则,以接受概率为概率接受候选状态。
4. 重复2-3步骤,直到达到一定的采样次数或收敛到平稳分布。
在高斯混合模型中,我们可以使用一个高斯分布来作为提议分布,并计算接受概率。具体地,我们可以按照以下步骤进行:
1. 从当前状态出发,根据一个高斯分布生成一个候选状态。
2. 计算接受概率,即由当前状态转移到候选状态的概率与由候选状态转移到当前状态的概率之比。在高斯混合模型中,接受概率可以根据当前状态和候选状态的概率密度函数计算得到。
3. 如果接受概率大于等于1,直接接受候选状态;否则,以接受概率为概率接受候选状态。
4. 重复1-3步骤,直到达到一定的采样次数或收敛到平稳分布。
通过上述步骤,我们可以使用MCMC算法从高斯混合模型中采样得到样本点。
相关问题
mcmc采样python代码
MCMC采样是一种用于生成随机样本的统计方法。在Python中,可以使用NumPy和SciPy库来实现MCMC采样。下面是一个简单的例子:
```python
import numpy as np
from scipy.stats import norm
# 定义目标分布
def target_distribution(x):
return np.exp(-x**2) * norm.pdf(x, loc=1, scale=2)
# 定义MCMC采样函数
def mcmc_sampling(target_distribution, proposal_distribution, num_samples):
# 初始状态
current_sample = 0
samples = []
for i in range(num_samples):
# 从建议分布中采样
proposed_sample = proposal_distribution(current_sample)
# 计算接受概率
acceptance_probability = min(1, target_distribution(proposed_sample) / target_distribution(current_sample) * proposal_distribution(current_sample) / proposal_distribution(proposed_sample))
# 决定是否接受
if np.random.uniform(0, 1) < acceptance_probability:
current_sample = proposed_sample
samples.append(current_sample)
return np.array(samples)
# 定义建议分布
def gaussian_proposal(x):
return np.random.normal(x, 1)
# 进行MCMC采样
samples = mcmc_sampling(target_distribution, gaussian_proposal, 10000)
# 绘制结果
import matplotlib.pyplot as plt
plt.hist(samples, bins=50, density=True)
x_range = np.linspace(-4, 4, 1000)
plt.plot(x_range, target_distribution(x_range))
plt.show()
```
这个例子中,我们定义了一个目标分布 `target_distribution`,它表示我们要采样的分布。我们还定义了一个建议分布 `gaussian_proposal`,它用于从当前状态生成建议样本。在 `mcmc_sampling` 函数中,我们使用这两个分布进行MCMC采样,并返回一组采样结果。最后,我们使用Matplotlib绘制了采样结果和目标分布的直方图。
举一个mcmc-h的例子
MCMC-H (MCMC with Hamiltonian dynamics) 是一种基于物理学的 MCMC 方法,它使用 Hamiltonian 动力学的方法来构建马尔可夫链,从而提高采样效率。一个典型的 MCMC-H 的例子是使用 Hamiltonian Monte Carlo (HMC) 方法来从多维高斯分布中采样。
假设我们有一个 $D$ 维高斯分布 $p(x)$,我们想要从该分布中采样一些样本。HMC 的过程是这样的:首先,我们引入一个动量变量 $v$,它是一个 $D$ 维向量,并且服从标准正态分布 $p(v) = \mathcal{N}(0, I)$;然后我们构造一个 Hamiltonian,它是动量和位置的函数,定义为 $H(x, v) = -\log p(x) + \frac{1}{2}v^Tv$;接着我们用 Hamiltonian 动力学的方法来模拟系统的演化,从而得到一个新的状态 $(x', v')$,这个过程可以通过一些数值方法来求解 Hamiltonian 方程得到;最后我们按照一定的概率接受或者拒绝这个新状态,从而得到一个新的样本。
HMC 方法相比于传统的 MCMC 方法具有更高的采样效率,因为它通过使用物理学的方法来模拟系统的演化,从而可以跨越那些低概率区域,从而提高采样效率。
阅读全文