> exp = as.matrix(exp) table(str_sub(colnames(exp),14,15)) Error: unexpected symbol in "exp = as.matrix(exp) table"

这段代码是尝试在R语言中进行操作的，但是存在语法错误。`table`函数在R语言中用于创建频数表，而`str_sub`函数则是用来提取字符串的某个部分，这两个函数通常不直接链式使用。错误信息提示了`table`函数之前有一个未预期的符号，这很可能是因为在写代码时没有正确地使用逗号或者其他运算符来分隔函数调用。

正确的代码可能是想要先将数据框`exp`转换为矩阵，然后提取列名的特定部分，并使用`table`函数来统计出现的频率。假设`colnames(exp)`返回的是字符型的列名，并且我们想要提取每个列名的第14个到第15个字符。下面是一个修正后的代码示例：

exp <- as.matrix(exp)  # 将exp转换为矩阵
colnames_part <- str_sub(colnames(exp), 14, 15)  # 提取列名的第14到第15个字符
table_result <- table(colnames_part)  # 计算每个字符组合出现的次数

这段代码应该可以正常运行，并且会输出一个频数表，显示`colnames_part`中每个唯一字符组合的出现次数。

相关问题

> exp=as.matrix(exp)table(str_sub(colnames(exp),14,15)) Error: unexpected symbol in "exp=as.matrix(exp)table"

在您提供的代码片段中，您似乎想要将一个名为`exp`的数据框转换为矩阵，并使用`table`函数对转换后的矩阵的列名进行某些操作。错误信息提示`unexpected symbol`，表明在执行`table`函数时出现了语法错误。正确的语法应该是首先使用`as.matrix`函数将数据框`exp`转换为矩阵，然后对这个矩阵的列名进行处理，最后使用`table`函数。

根据您提供的代码，可能您想执行的操作是提取列名的某一部分，然后生成一个频率表。这可以通过在`table`函数之前添加正确的函数来实现。以下是一个可能的修改后的代码示例：

# 假设exp原本是一个数据框
exp_matrix <- as.matrix(exp)
# 提取列名的第14到第15个字符，并创建一个table
frequency_table <- table(str_sub(colnames(exp_matrix), 14, 15))

这段代码首先将`exp`转换为矩阵`exp_matrix`，然后使用`str_sub`函数从列名中提取第14到第15个字符，并最终使用`table`函数统计每个唯一字符组合出现的频率。

> genes <- read.table("genes.tsv", header = TRUE, stringsAsFactors = FALSE) > barcodes <- read.table("barcodes.tsv", header = TRUE, stringsAsFactors = FALSE) > matrix <- readMM("matrix.mtx") > exp_matrix <- Matrix::t(as.data.frame(as.matrix(matrix))) > rownames(exp_matrix) <- genes$V2 > colnames(exp_matrix) <- barcodes$V1 > pbmc <- CreateSeuratObject(counts = exp_matrix, project = "pbmc", assay = "RNA") Error in CreateAssayObject(counts = counts, min.cells = min.cells, min.features = min.features, : No cell names (colnames) names present in the input matrix，是什么错误，怎么解决

这个错误提示表明，在从文件中读取数据后，没有在读取的数据中找到任何列名，也就是没有细胞名称。这通常是由于读取的数据文件格式不正确导致的。

你可以尝试检查以下几个问题：

1. 检查`genes.tsv`和`barcodes.tsv`文件是否存在，并且文件路径是否正确。
2. 检查`matrix.mtx`文件是否存在，并且文件路径是否正确。
3. 检查`genes.tsv`和`barcodes.tsv`文件中是否有正确的列名。
4. 检查`matrix.mtx`文件是否以正确的格式存储了数据。

如果以上步骤都没有解决问题，你可以尝试打印读取的数据，以便进一步调试。