conda安装Viennarna包，在终端输入RNAfold -v,可以计算RNA二级结构和最小自由能，但是在pycharm远程链接服务器无法使用

如果您能在终端中成功使用RNAfold命令计算RNA二级结构和最小自由能，但在PyCharm中无法使用，则可能是因为PyCharm无法找到ViennaRNA软件包的路径。为了让PyCharm能够调用ViennaRNA软件包中的RNAfold命令，您需要在PyCharm的配置中添加ViennaRNA软件包的路径。

具体步骤如下：

1. 打开PyCharm，进入项目的配置界面。

2. 选择“Project Interpreter”，并点击右上角的“+”按钮，打开“Add Python Interpreter”对话框。

3. 在对话框中选择“Conda Environment”，并选择您之前创建的ViennaRNA环境。

4. 点击“OK”按钮，等待PyCharm安装ViennaRNA环境中的所有依赖项。

5. 安装完成后，在PyCharm中打开一个Python文件，并尝试导入RNA模块：

   import RNA

6. 如果没有出现任何错误，表示ViennaRNA环境已经成功配置，您可以在PyCharm中使用RNAfold命令进行RNA二级结构和最小自由能计算。

希望这可以帮助您成功在PyCharm中使用ViennaRNA软件包中的RNAfold命令进行RNA结构预测。