R语言 读取csv文件,按照“Buf30m_ID”属性随机抽取一个样本组成训练集,再按照“FishNet_ID”属性(数值1-10)分成十个子集,作为验证集;进行留一法交叉验证(即随机抽取9个子集训练模型,剩余1个子集验证模型),同时进行超参数寻优,根据RMSE确定最优参数与模型
时间: 2024-12-28 17:38:54 浏览: 12
在R语言中,你可以使用`read.csv`函数来读取CSV文件,然后通过`sample`函数随机抽样训练集。首先,让我们分步骤进行:
1. **读取CSV文件**:
使用`read.csv`函数加载数据,假设你的CSV文件名为"data.csv":
```R
data <- read.csv("data.csv", stringsAsFactors = FALSE) # 加上stringsAsFactors = FALSE以保留字符串原样
```
2. **随机抽取训练集**:
根据"Buf30m_ID"属性抽取指定大小的样本作为训练集。例如,如果需要10%的数据作为训练集:
```R
train_size <- round(nrow(data) * 0.1)
train_indices <- sample(1:nrow(data), size = train_size, replace = FALSE, prob = NULL)
train_data <- data[train_indices, ]
```
3. **按"FishNet_ID"划分验证集**:
对于"FishNet_ID"属性,创建一个因素向量并分割成十组验证集:
```R
fish_ids <- factor(data$FishNet_ID, levels = 1:10)
validation_sets <- split(train_data, fish_ids)
```
4. **留一法交叉验证**:
这里你需要循环遍历每个验证子集,每次使用剩下的九个子集作为训练集,其中一个子集作为验证集。可以使用`lapply`结合`trainControl`和`train`函数实现:
```R
library(caret)
control <- trainControl(method = "cv", number = 10, returnResamp = "final") # 留一交叉验证,10折
best_models <- lapply(1:length(validation_sets), function(i) {
index_to_exclude <- i
train_data_sub <- validation_sets[-index_to_exclude]
model <- train(
# 你的响应变量 ~ 各自特征列名,
formula = your_response_variable ~ .,
data = train_data_sub,
method = "your_model_algorithm", # 选择适当的回归算法如lm、randomForest等
trControl = control,
tuneGrid = your_tune_grid, # 超参数网格
metric = "RMSE"
)
list(model = model, rmse = sqrt(mean(model$results$rmse)))
})
```
5. **评估与选择最优参数**:
最终的`best_models`列表会包含每个子集训练得到的模型及其对应的RMSE值。你可以通过比较`rmse`找到最小的那个,这将是优化后的模型。
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