fasta文件id后面加东西 python

你可以使用 Python 的字符串操作来在 FASTA 文件中的 ID 后面添加东西。下面是一个示例代码，它可以在每个 ID 后面添加 "_new"。

import os

# 输入文件名和输出文件名
input_file = "example.fasta"
output_file = "example_new.fasta"

# 检查输入文件是否存在
if not os.path.exists(input_file):
    print("Error: Input file does not exist!")
    exit()

# 打开输入文件和输出文件
with open(input_file, "r") as f_in, open(output_file, "w") as f_out:
    # 初始化变量
    current_id = ""
    current_seq = ""

    # 读取输入文件的每一行
    for line in f_in:
        # 如果这一行是 ID 行，则保存上一个序列并更新当前 ID
        if line.startswith(">"):
            if current_id:
                f_out.write(current_id + "_new\n")
                f_out.write(current_seq + "\n")
            current_id = line.strip()
            current_seq = ""
        # 如果这一行是序列行，则将序列加入当前序列中
        else:
            current_seq += line.strip()

    # 保存最后一个序列
    if current_id:
        f_out.write(current_id + "_new\n")
        f_out.write(current_seq + "\n")

print("Done!")

在这个代码中，我们首先检查输入文件是否存在，然后打开输入文件和输出文件。接下来，我们逐行读取输入文件，并检查每一行是否是 ID 行。如果是 ID 行，我们将上一个序列写入输出文件，并更新当前 ID。如果这一行是序列行，则将序列加入当前序列中。在处理完所有行之后，我们将最后一个序列写入输出文件中，并关闭输入文件和输出文件。

在这个示例代码中，我们在每个 ID 后面添加了 "_new"。你可以根据需要修改这个代码，在 ID 后面添加其他字符串。