用Liunx源代码下载samtools时报错configure: error: expected an absolute directory name for --prefix: ./samtoolslocation
时间: 2024-09-21 17:12:46 浏览: 150
MySQL 启动报错:File ./mysql-bin.index not found (Errcode: 13)
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当你在Linux上尝试使用源码包安装samtools时,遇到`configure: error: expected an absolute directory name for --prefix: ./samtoolslocation`这个错误,它意味着在配置过程(通常通过运行`./configure`命令)中,`--prefix`选项指定了安装位置,但是提供的路径不是一个绝对路径。
`--prefix`选项用于指定程序将被安装到系统的哪个位置,比如 `/usr/local` 或自定义目录。然而,这里给的是 `./samtoolslocation`,这表示从当前目录下的 `samtoolslocation` 文件夹开始,不是绝对路径。
解决这个问题的方法是提供一个绝对路径。例如,如果你想安装到默认的系统位置,可以使用:
```sh
./configure --prefix=/usr/local
```
如果你有一个特定的自定义目录,确保使用 `/your/custom/directory` 替换上面的路径。
如果`./samtoolslocation`是你想要的安装位置,那么应该先切换到包含samtools源文件的那个目录,然后再运行 configure 命令:
```sh
cd /path/to/samtools/source
./configure --prefix=./samtoolslocation
```
确认你有足够的权限访问并创建这个目录,然后继续安装流程。
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