metabolites_clumping = mutate(metabolites_clumping,F=(samplesize.exposure-2)*((R*R)/(1-R*R)))
时间: 2023-12-17 18:02:06 浏览: 33
这是一个使用R语言的mutate函数,对数据框metabolites_clumping进行变异操作。其中,F是新添加的一列,计算公式为(samplesize.exposure-2)*((R*R)/(1-R*R)),其中samplesize.exposure和R是metabolites_clumping数据框中已有的列名。具体的计算意义需要结合数据的具体情况进行分析。
相关问题
metabolites_clumping = mutate(myalldata, R=get_r_from_bsen(myalldata$beta.exposure, myalldata$se.exposure, myalldata$samplesize.exposure))
这是一个R语言的代码,使用了mutate函数对myalldata进行变异,并计算了R值,R值是通过使用get_r_from_bsen函数从myalldata的beta.exposure、se.exposure和samplesize.exposure计算得出的。具体的功能和上下文需要看完整的代码才能确定。
已知代谢物个数有76个,一级分类有8个,二级分类有6个,如何用R语言绘制旭日图
你可以使用`ggplot2`和`ggforce`这两个R包来绘制旭日图。下面是基本的代码:
```
library(ggplot2)
library(ggforce)
# 创建数据框
set.seed(123)
data <- data.frame(
level1 = rep(letters[1:8], each = 9),
level2 = rep(LETTERS[1:6], each = 3),
metabolite = paste0("M", 1:76),
value = runif(76, 1, 100)
)
# 计算每个级别的值
data_agg <- aggregate(value ~ level1 + level2, data = data, sum)
# 绘图
ggplot(data_agg, aes(fill = level2)) +
geom_sunburst(aes(subdivision = value)) +
scale_fill_manual(values = rainbow(length(unique(data_agg$level2)))) +
theme_void() +
theme(legend.position = "bottom") +
labs(title = "Metabolites by Classification", fill = "Level 2")
```
这个代码会生成一张旭日图,其中每个环代表一级分类,环内的分支代表二级分类,最里面的环则代表代谢物。每个分支的颜色表示二级分类,分支的大小则代表该分类下所有代谢物的总值。
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