Load “BreastCancer” dataset from “mlbench” package, perform PCA analysis on columns 2 to 10 of the dataset as features and use PC1 and PC2 to plot a PCA result graph (indicating tumor types with different colors), recommended to use the “ggplot2”package for plotting.

时间: 2023-12-21 14:03:57 浏览: 74
Sure, here's how you can do it: ```R # Load required packages library(mlbench) library(ggplot2) # Load BreastCancer dataset data(BreastCancer) # Perform PCA analysis on columns 2 to 10 of the dataset as features pca <- prcomp(BreastCancer[, 2:10], scale. = TRUE) # Extract PC1 and PC2 scores pc_scores <- data.frame(PC1 = pca$x[, 1], PC2 = pca$x[, 2], Type = BreastCancer$Type) # Plot PCA result graph using ggplot2 ggplot(pc_scores, aes(x = PC1, y = PC2, color = Type)) + geom_point() + ggtitle("PCA analysis of BreastCancer dataset") + xlab("PC1") + ylab("PC2") ``` This code will load the BreastCancer dataset from the mlbench package, perform PCA analysis on columns 2 to 10 of the dataset as features, and use PC1 and PC2 to plot a PCA result graph. The tumor types will be indicated with different colors. Finally, ggplot2 package is used for plotting.
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