R语言分析2015年未患CMM的人2018年是否患CMM,其中BMI与CMM的关联,计算HR
时间: 2024-09-16 09:00:44 浏览: 35
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在R语言中,你可以使用生存分析(Survival Analysis)方法来研究2015年未患有结肠直肠息肉病(Colorectal Mucinous Metastases, CMM)的人群到2018年的发病情况,并探究BMI(身体质量指数)与其发病关联及计算 Hazard Ratio (HR)。这里假设你已经有了包含这些人基本信息、BMI和随访结果的数据集。
首先,你需要安装并加载相关的R包,如`survival`和`dplyr`:
```r
install.packages(c("survival", "dplyr"))
library(survival)
library(dplyr)
```
然后,假设数据集名为`data`, 包含`year`, `cmm_status`(0表示未患CMM,1表示患病),`bmi`等列:
```r
data <- read.csv("your_data.csv") # 替换为你的数据文件路径
# 确保所有人在2015年前都是无CMM状态
data <- filter(data, year == 2015 & cmm_status == 0)
```
接下来,你可以构建一个 Cox 比较模型,其中BMI是协变量:
```r
# 创建时间变量(从2015到2018)
data$followup <- 2018 - data$year
# 创建生存表
surv_table <- Surv(followup, cmm_status) ~ bmi, data = data
# 训练Cox回归模型
cox_model <- coxph(surv_table)
# 获取BMI与CMM的HR
hr_bmi <- exp(cox_model$coefficients["bmi"])
# 打印HR及其95%置信区间
print(cox_model)
```
`exp(cox_model$coefficients["bmi"])`给出的就是BMI每增加一个单位时CMM发病风险的相对变化,即HR。如果HR大于1,说明BMI越高,患CMM的风险越大;反之,则说明BMI与CMM发病呈负相关。
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