MEDICAL & BIOLOGICAL ENGINEERING & COMPUTING

时间: 2023-11-25 07:45:36 浏览: 40
MEDICAL & BIOLOGICAL ENGINEERING & COMPUTING(MBEC)是一本医学与生物工程和计算的期刊。该期刊涵盖了生物医学和临床工程的整个范围,并旨在介绍生物医学科学和技术方面的实验和理论发展。它报道了这些多学科领域中基于计算机的方法学的进展,并努力纳入新的和新兴的领域,如细胞工程、分子成像和不断变化的技术。MBEC出版原创研究文章和评论文章。您可以在该期刊的官方网站 https://www.springer.com/11517 获取更多信息,或者在该杂志的投稿地址 https://www.editorialmanager.com/MBEC 进行投稿。
相关问题

python如何扩展Biological sequence这种类(class)的属性和方法

要扩展Biological sequence类的属性和方法,可以使用继承。继承是一种从已有类创建新类的方法,新类可以继承已有类的属性和方法,并且可以添加新的属性和方法。 例如,假设我们有一个Biological sequence类: ```python class BiologicalSequence: def __init__(self, sequence, sequence_type): self.sequence = sequence self.sequence_type = sequence_type def length(self): return len(self.sequence) def complement(self): raise NotImplementedError() ``` 现在,我们想扩展这个类,添加一个新的属性和方法。我们可以创建一个新类,继承Biological sequence类,并添加新的属性和方法: ```python class DnaSequence(BiologicalSequence): def gc_content(self): gc_count = self.sequence.count('G') + self.sequence.count('C') return gc_count / self.length() def complement(self): complement_dict = {'A': 'T', 'T': 'A', 'C': 'G', 'G': 'C'} complement_sequence = ''.join([complement_dict[base] for base in self.sequence]) return DnaSequence(complement_sequence, self.sequence_type) ``` 在这个新类中,我们添加了一个gc_content方法,用于计算DNA序列的GC含量,同时重写了Biological sequence类的complement方法,用于计算DNA序列的互补序列。 现在,我们可以创建一个DnaSequence对象,并使用新的属性和方法: ```python dna = DnaSequence('ATCGATCG', 'DNA') print(dna.length()) # 8 print(dna.gc_content()) # 0.5 print(dna.complement().sequence) # TAGCTAGC ``` 通过继承和重载,我们扩展了BiologicalSequence类的功能,使其更加适合DNA序列的操作。

BE编辑技术的研究进展

BE编辑技术(Biological Engineering Editing Technology)是指在生物工程学中使用的一种编辑技术,用于精确控制和修改生物体内的基因或基因组。这种技术有助于更好地了解和控制生物体内的生物过程,并可能在医学和农业等领域发挥重要作用。 近年来,BE编辑技术的研究进展非常迅速。其中最著名的编辑技术是CRISPR/Cas9,这种技术可以快速、精确地编辑基因,并已在多种研究和临床应用中得到广泛使用。此外,还有一些其他的编辑技术,如TALENs和ZFNs,也在不断发展。 随着技术的进步,BE编辑技术在许多领域的应用也在不断扩展。例如,在医学领域,BE编辑技术可用于修复基因缺陷,治疗基因相关的疾病,如癌症、遗传性疾病等。在农业领域,BE编辑技术可用于改良农作物,增加产量,抵抗病虫害等。 总的来说,BE编辑技术的研究和应用前景非常广阔,它将在未来发挥重要作用。但是,在推广应用

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精简下面表达:Existing protein function prediction methods integrate PPI networks and multivariate bioinformatics data to improve the performance of function prediction. By combining multivariate information, the interactions between proteins become diverse. Different interactions’ functions in functional prediction are various. Combining multiple interactions simply between two proteins can effectively reduce the effect of false negatives and increase the number of predicted functions, but it can also increase the number of false positive functions, which contribute to nonobvious enhancement for the overall functional prediction performance. In this article, we have presented a framework for protein function prediction algorithms based on PPI network and semantic similarity with the addition of protein hierarchical functions to them. The framework relies on diverse clustering algorithms and the calculation of protein semantic similarity for protein function prediction. Classification and similarity calculations for protein pairs clustered by the functional feature are more accurate and reliable, allowing for the prediction of protein function at different functional levels from different proteomes, and giving biological applications greater flexibility.The method proposed in this paper performs well on protein data from wine yeast cells, but how well it matches other data remains to be verified. Yet until now, most unknown proteins have only been able to predict protein function by calculating similarities to their homologues. The predictions result of those unknown proteins without homologues are unstable because they are relatively isolated in the protein interaction network. It is difficult to find one protein with high similarity. In the framework proposed in this article, the number of features selected after clustering and the number of protein features selected for each functional layer has a significant impact on the accuracy of subsequent functional predictions. Therefore, when making feature selection, it is necessary to select as many functional features as possible that are important for the whole interaction network. When an incorrect feature was selected, the prediction results will be somewhat different from the actual function. Thus as a whole, the method proposed in this article has improved the accuracy of protein function prediction based on the PPI network method to a certain extent and reduces the probability of false positive prediction results.

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