bulk RNA-seq

Bulk RNA-seq，全称为大规模RNA测序，是一种高通量基因表达分析技术，用于研究生物体内的转录组学。它涉及从大量细胞或组织中提取总RNA，然后通过逆转录过程将RNA转化为互补DNA（cDNA），接着进行文库构建和测序。通过这种方法，科学家可以得到整个细胞样本中所有基因转录本的数量信息，用于检测基因的表达水平、差异表达分析以及功能注释等研究。

Bulk RNA-seq的主要步骤包括：
1. 纯化总RNA：使用特定的试剂盒从细胞或组织中提取RNA。
2. 阳性选择或随机断裂：选择性地保留全长mRNA或随机打断RNA分子，生成各种大小的cDNA片段。
3. 文库制备：将处理后的cDNA连接到接头并富集成DNA克隆群体，形成测序图书馆。
4. 高通量测序：利用新一代测序技术（如Illumina）对文库进行大规模平行测序，产生大量的碱基序列数据。
5. 数据分析：比对序列至参考基因组，统计每个基因的读数，计算表达丰度，并进行差异表达分析。