slurm gpu部署

SLURM是一种广泛使用的集群管理器，特别适用于HPC（高性能计算）环境。在SLURM中管理GPU资源通常涉及以下几个步骤：

1. **配置SLURM**：首先，你需要在SLURM的配置文件中（如/etc/slurm-llnl.conf）添加对GPU的支持。这通常涉及到设置`CUDA_VISIBLE_DEVICES`变量、`SBATCH_gpu`或`SBATCH_GPUS_PER_TASK`等选项。

2. **模块系统**：许多机构使用模块系统来加载CUDA和其他GPU相关的库。你可以创建一个特定于GPU的任务模块，使得用户能够通过命令行轻松地请求带有GPU的工作节点。

3. **GPU分区**：在SLURM中，可以创建一个专门针对GPU计算的分区，比如`gres=gpu`. 这样，只有拥有足够GPU资源的任务才会被调度到相应的节点上。

4. **任务脚本**：在运行需要GPU的任务时，要在脚本中明确指定依赖GPU，例如使用`srun --gres=gpu ...`命令。

5. **限制和配额**：为了管理和控制GPU的使用，可以设定单个用户的GPU配额或整个系统的GPU总量。

6. **监控和日志**：安装适当的监控工具可以帮助管理员跟踪GPU的使用情况，并记录性能数据。

相关问题

slurm gpu 配置

在使用 Slurm 进行 GPU 配置时，需要进行以下步骤：

1. 确认节点上是否有 GPU 设备，可以使用 nvidia-smi 命令查看。
2. 在 Slurm 配置文件中添加 GPU 相关配置，例如：

GresTypes=gpu
NodeName=compute-0-[0-7] Gres=gpu:tesla:4

其中，GresTypes 指定了可用的资源类型，NodeName 指定了节点名称和节点上可用的资源数量。

3. 在提交作业时，需要指定使用的 GPU 资源数量，例如：

srun --gres=gpu:1 ./my_program

这样就可以在作业中使用一个 GPU 资源了。

slurm集群部署教程

Slurm 是一个开源的高性能计算集群管理系统，用于在大规模计算环境中调度、管理和监控作业。下面是一些关于如何部署 Slurm 集群的基本教程：

## 1. 安装 Slurm

首先，需要在所有计算节点和管理节点上安装 Slurm。可以通过源代码或二进制软件包进行安装。

### 安装依赖

在安装 Slurm 之前，需要安装一些依赖，包括 Munge、OpenSSL、PAM、Numactl、MySQL 或 MariaDB、Python 等。可以通过以下命令安装这些依赖：

sudo apt-get update
sudo apt-get install munge libmunge-dev openssl libssl-dev libpam0g-dev numactl \
                     mariadb-server libmysqlclient-dev python3-dev python3-pip

### 安装 Slurm

可以从官方网站下载最新版本的 Slurm 源代码：https://www.schedmd.com/downloads.php。然后将源代码解压缩并进行编译和安装。

tar xzf slurm-20.11.7.tar.gz
cd slurm-20.11.7
./configure --prefix=/usr/local
make
sudo make install

## 2. 配置 Slurm

在安装完 Slurm 后，需要配置集群。主要包括以下步骤：

### 配置 Munge

Slurm 需要 Munge 来进行身份验证和加密。需要在所有节点上安装 Munge，并生成一个共享密钥。

sudo apt-get install munge
sudo systemctl enable munge
sudo systemctl start munge
sudo /usr/sbin/munged --force
sudo dd if=/dev/random bs=1 count=1024 >/etc/munge/munge.key
sudo chmod 400 /etc/munge/munge.key
sudo chown munge:munge /etc/munge/munge.key

将生成的密钥复制到所有节点上。

### 配置 Slurm 配置文件

Slurm 的配置文件为 `/usr/local/etc/slurm.conf`。可以使用以下命令创建一个基本的配置文件：

sudo mkdir -p /etc/slurm-llnl
sudo cp /usr/local/etc/slurm.conf.example /etc/slurm-llnl/slurm.conf

然后，编辑配置文件并根据需要进行更改。以下是一些常用的配置项：

ControlMachine=<管理节点IP地址>
MpiDefault=none
SlurmUser=<Slurm用户>
SlurmdUser=<slurmd用户>
AuthType=auth/munge
CryptoType=crypto/munge

### 配置 slurmdbd

slurmdbd 是一个用于将作业信息和节点状态存储在数据库中的守护进程。需要在管理节点上安装 MySQL 或 MariaDB，并创建一个数据库和一个用户。

sudo apt-get install mariadb-server libmysqlclient-dev
sudo systemctl enable mariadb
sudo systemctl start mariadb
sudo mysql_secure_installation
sudo mysql -u root -p

在 MySQL 命令行界面上，输入以下命令来创建数据库和用户：

CREATE DATABASE slurm_acct_db;
GRANT ALL ON slurm_acct_db.* TO 'slurm'@'localhost' IDENTIFIED BY 'password';
FLUSH PRIVILEGES;

然后，编辑 `/etc/slurm-llnl/slurmdbd.conf` 文件，并根据需要进行更改。以下是一些常用的配置项：

DbdAddr=<管理节点IP地址>
DbdHost=<管理节点主机名>
StorageType=accounting_storage/mysql
DbdUser=<MySQL用户名>
DbdPass=<MySQL用户密码>
DbName=slurm_acct_db

### 配置节点

在每个计算节点上，需要编辑 `/etc/slurm-llnl/slurmd.conf` 文件，并根据需要进行更改。以下是一些常用的配置项：

ControlMachine=<管理节点IP地址>
AuthType=auth/munge
CryptoType=crypto/munge

然后，启动 `slurmd` 守护进程：

sudo systemctl enable slurmd
sudo systemctl start slurmd

## 3. 启动 Slurm

在完成所有配置后，可以启动 Slurm。首先，需要启动 `slurmdbd` 守护进程：

sudo systemctl enable slurmdbd
sudo systemctl start slurmdbd

然后，在管理节点上启动 `slurmctld` 守护进程：

sudo systemctl enable slurmctld
sudo systemctl start slurmctld

## 4. 测试 Slurm

可以使用以下命令测试 Slurm 是否正常工作：

srun -N <节点数> -n <任务数> hostname

例如：

srun -N 2 -n 4 hostname

运行此命令后，应该会在终端上看到所有节点的主机名。如果一切正常，则表示 Slurm 已经正确安装和配置。

以上是一个基本的 Slurm 集群部署教程，如果需要更高级的配置和管理，请参考 Slurm 官方文档。