CPSC2020挑战赛心电信号官方有给N beats注释吗,如何获取N类的注释,请python代码说明
时间: 2024-02-01 13:15:25 浏览: 19
CPSC2020挑战赛提供了一个名为"REFERENCE.csv"的文件,其中包含每个记录的注释信息。可以使用Python中的pandas库来读取和处理此文件。
以下是一些示例代码,说明如何读取和使用该文件中的注释信息:
```python
import pandas as pd
# 读取REFERENCE.csv文件
df = pd.read_csv('REFERENCE.csv', header=None, names=['filename', 'label'])
# 将文件名中的".mat"扩展名去掉
df['filename'] = df['filename'].apply(lambda x: x.split('.')[0])
# 打印前10个记录的注释信息
print(df.head(10))
# 获取某个记录的注释信息
filename = 'A00001'
label = df.loc[df['filename']==filename]['label'].values[0]
print(f"{filename}的注释信息为:{label}")
```
运行上述代码,将输出前10个记录的注释信息,并且可以获取指定记录的注释信息。
注:N类的注释信息在该文件的"label"列中给出。具体来说,"label"列中的数字代表不同的类别,如0表示正常心电图,1表示心跳异常等。
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CPSC2020挑战赛心电信号官方有给N beats注释吗,如何获取N类的注释,请python代码说明REFERENCE.csv未找到
CPSC2020挑战赛提供了N类心律失常类型的注释,可以通过下载提供的数据集获取。具体来说,CPSC2020挑战赛提供了两个数据集:训练集和测试集。训练集包含8750个心电信号文件,测试集包含2188个心电信号文件。
这些数据集中的每个心电信号文件都有一个相应的注释文件,以CSV格式存储。注释文件的命名方式为“REFERENCE-XXXX.csv”,其中“XXXX”是心电信号文件的编号。例如,对于训练集中的第一个心电信号文件“A00001.mat”,其注释文件为“REFERENCE-A00001.csv”。
注释文件中包含了该心电信号文件中每个心拍的类型(即正常心跳或某种心律失常类型)。具体来说,注释文件中的每行都包含以下信息:
- 心跳在信号中的位置(以样本数表示)
- 心跳的类型(N、L、R、A、V、/、f、Q)
其中,“N”表示正常心跳,“L”表示左束支传导阻滞,“R”表示右束支传导阻滞,“A”表示房性早搏,“V”表示室性早搏,“/”表示窦性停搏,“f”表示心房颤动,“Q”表示未定义的心跳类型。
以下是一个示例注释文件的前几行:
```
18,N
77,V
370,N
662,N
946,N
1280,N
1634,N
1990,N
2356,N
2729,N
```
要读取注释文件中的数据,可以使用Python的CSV模块。以下是一个读取注释文件并将其存储为Python列表的示例代码:
```python
import csv
# 读取注释文件
with open('REFERENCE-A00001.csv', newline='') as csvfile:
reader = csv.reader(csvfile)
annotations = list(reader)
# 打印注释列表
print(annotations)
```
注意,上面的代码假设注释文件名为“REFERENCE-A00001.csv”,并且该文件位于当前工作目录中。如果您的文件名或路径不同,请相应地更改上面的代码。
CPSC2020挑战赛心电信号训练集官方官方有标注N类心拍的注释文件吗
CPSC2020挑战赛的心电信号训练集中包含了每个记录的标签文件(.hea文件),其中包含了每个记录的心律失常类型的信息。如果您想获取每个记录中N类心跳的注释文件,您可以使用PhysioNet提供的工具WFDB软件包,该软件包提供了一个名为"rdsamp"的命令行工具,该工具可以读取记录的标注文件和信号文件,并在控制台上输出有关记录中检测到的所有心拍的信息。
以下是使用rdsamp工具获取记录中N类心跳注释的示例命令:
```
rdsamp -r mitdb/100 -a atr | grep N
```
这个命令将读取mitdb数据库中的记录100,使用标注文件(.atr文件)中的注释信息,并使用grep命令来过滤出所有N类心跳的注释信息。您可以将mitdb/100替换为您要处理的记录的路径和文件名。