我想用python提取pyradiomics中"Original"的一个特征entropy,请问应该怎么具体设置配置文件
时间: 2023-05-29 10:05:03 浏览: 216
要提取PyRadiomics中"Original"的entropy特征,您需要在配置文件中设置以下内容:
1. 设置特征计算器为"original_firstorder",以计算原始图像的第一阶段特征。
```
featureClass:
name: 'pyradiomics.firstorder'
enabled: true
kwargs:
label: 1
minimumROIDimensions: 2
normalize: true
voxelBased: false
additionalInfo: true
featureSettings:
original_firstorder:
enabled: true
```
2. 在"original_firstorder"中启用"Entropy"特征。
```
featureClass:
name: 'pyradiomics.firstorder'
enabled: true
kwargs:
label: 1
minimumROIDimensions: 2
normalize: true
voxelBased: false
additionalInfo: true
featureSettings:
original_firstorder:
enabled: true
Entropy:
enabled: true
```
3. 保存配置文件并使用pyradiomics计算特征。
```
import os
import radiomics
# 加载配置文件
params = os.path.join(radiomics.__path__[0], 'exampleSettings', 'Params.yaml')
# 计算特征
extractor = radiomics.featureextractor.RadiomicsFeatureExtractor(params)
featureVector = extractor.execute(imageFilePath, maskFilePath)
```
其中,"imageFilePath"和"maskFilePath"分别为原始图像和掩模文件的路径。计算完成后,您可以在"featureVector"中找到提取的"Entropy"特征值。
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