上述程序改为使用数组
时间: 2024-12-24 08:31:38 浏览: 3
当然可以将程序转换为使用数组来存储基因信息。我们首先定义一个数组,其中每个元素代表一个基因及其外显子列表。这里是一个基于数组的版本:
```perl
# 定义DNA序列
my $dna_seq = 'CTCAAAAGTCTAGAGCCACCGTCCAGGGAGCAGGTAGCTGCTGGGCTCCGGGGACAC...';
# 创建基因信息数组
my @genomes = (
{ id => 1, exons => [[1, 3], [6, 8], [10, 12]] },
{ id => 2, exons => [[15, 20]] },
{ id => 3, exons => [[25, 27], [30, 32]] }
);
# 初始化编码序列数组
my @encoded_seqs;
# 遍历基因数组
foreach my $genome (@genomes) {
my $start = 0;
foreach my $exon (@{$genome->{exons}}) {
# 提取外显子片段
my $exon_seq = substr($dna_seq, $start+$exon->[0]-1, $exon->[1]-$exon->[0]);
push @encoded_seqs, $exon_seq if length($exon_seq); # 只添加非空片段
$start += $exon->[1]; # 更新搜索起始位置到下一个外显子之前
}
}
# 输出编码序列
foreach my $encoded_seq (@encoded_seqs) {
printf("基因%d的编码序列: %s\n", $_->id, $encoded_seq);
}
```
在这个版本中,我们使用了一个名为`@genomes`的数组,其中每个元素都是一个包含基因ID和外显子列表的小型匿名哈希。我们遍历这个数组,逐个提取外显子并加入到`@encoded_seqs`数组中。需要注意的是,这里只添加非空的外显子片段。
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