sklearn.tsne

时间: 2024-08-16 14:03:04 浏览: 44
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tsne降维python可视化

sklearn中的t-SNE (T-Distributed Stochastic Neighbor Embedding) 是一种降维技术，用于非线性地将高维数据集映射到低维度空间（如二维或三维），同时尽可能保留原始数据点之间的相似结构。它基于两个关键假设：每个样本周围的数据点分布类似于学生t分布，以及邻近的样本在低维表示中有更高的概率共处于相近的位置。 t-SNE通过优化KL散度来最小化高维数据与低维嵌入之间的差异，这使得可视化大型、密集且高维的数据变得容易。在sklearn库中，可以使用`sklearn.manifold.TSNE`类来进行t-SNE转换，通常先对数据进行预处理，例如标准化或归一化，然后调用`fit_transform`方法生成嵌入结果。
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sklearn.manifold.tsne

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from sklearn.manifold import tsne

这是一个Python的机器学习库Scikit-learn中的一个模块，用于实现t-SNE（t-Distributed Stochastic Neighbor Embedding）算法，用于高维数据的降维和可视化。

Traceback (most recent call last): File "C:\Users\徐婷\Desktop\研究生学习\实验\参考实验\CR-VAE-main\CR-VAE-main\metrics\visualization_metrics.py", line 20, in <module> from sklearn.manifold import TSNE ModuleNotFoundError: No module named 'sklearn'错误在哪？怎么更正

这个错误是因为Python找不到名为'sklearn'的模块导致的。解决这个问题的方法是安装scikit-learn（通常使用pip安装）。可以在终端或命令提示符中输入以下命令： pip install scikit-learn 如果你已经安装了...

已经在anaconda prompt中安装了scikit-learn但是还是出现这种情况怎么解决Traceback (most recent call last): File "C:\Users\徐婷\Desktop\研究生学习\实验\参考实验\CR-VAE-main\CR-VAE-main\metrics\visualization_metrics.py", line 20, in <module> from sklearn.manifold import TSNE ModuleNotFoundError: No module named 'sklearn'

这个错误提示说明您的Python环境中未安装scikit-learn模块，或者是您在安装过程中出现了问题。您可以尝试以下方法解决： 1. 确认您的Anaconda环境中已经安装了scikit-learn。可以在Anaconda Prompt中输入以下命令来...

import pandas as pd from sklearn.manifold import TSNE import matplotlib.pyplot as plt # 读取数据集 customer = pd.read_csv('customer.csv',encoding='gbk') customer_data = customer.iloc[:,:-1] customer_target = customer.iloc[:,-1] # K-Means类聚 from sklearn.cluster import KMeans kmeans = KMeans(n_clusters=4,random_state=6).fit((customer_data)) # 使用TSNE进行数据降维，降成2维 tsne = TSNE(n_components=2,init='random', random_state=2).fit(customer_data) df = pd.DataFrame(tsne.embedding_) # 提取不同标签的数据 df1 = df[df['labels'] == 0] df2 = df[df['labels'] == 1] df3 = df[df['labels'] == 2] df4 = df[df['labels'] == 3] # 绘制图像 fig = plt.figure(figsize=(9,6)) # 用不同颜色表示不同数据 plt.plot(df1[0],df1[1],'bo',df2[0],df2[1],'r*', df3[0],df1[1],'gD',df4[0],df4[1],'kD') plt.show()这段代码有什么问题

df = pd.DataFrame(tsne.embedding_) df['labels'] = labels # 提取不同标签的数据 df1 = df[df['labels'] == 0] df2 = df[df['labels'] == 1] df3 = df[df['labels'] == 2] df4 = df[df['labels'] == 3] # ...

import os import numpy as np from PIL import Image from tensorflow.keras.applications.resnet50 import ResNet50, preprocess_input from sklearn.cluster import DBSCAN from sklearn.manifold import TSNE # 加载 ResNet50 模型 model = ResNet50(weights='imagenet', include_top=False) # 加载并预处理图片，提取特征向量 features = [] for filename in os.listdir('D:/wjd/2'): if filename.endswith('.png'): img = Image.open(os.path.join('D:/wjd/2', filename)) img = img.convert('RGB') # 将 RGBA 转换为 RGB img = img.resize((224, 224)) x = np.array(img) x = np.expand_dims(x, axis=0) x = preprocess_input(x) feature = model.predict(x) feature = np.squeeze(feature) features.append(feature) # 将特征向量进行降维处理 tsne = TSNE(n_components=2) features_tsne = tsne.fit_transform(features) # 将特征向量进行聚类，自动确定聚类的数量 dbscan = DBSCAN(eps=5, min_samples=2).fit(features_tsne) n_clusters = len(set(dbscan.labels_)) # 将每张图片分配到对应的聚类中 for i, label in enumerate(dbscan.labels_): filename = os.listdir('D:/wjd/2')[i] print('{} belongs to cluster {}'.format(filename, label))这段代码出现了AttributeError: 'list' object has no attribute 'shape'这个错误

TSNE 类的 fit_transform 方法需要的输入是一个 numpy 数组，因此，将 features 列表转换为 numpy 数组可能会解决这个问题。将以下行添加到代码中即可将 features 列表转换为 numpy 数组： features = ...

import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from PIL import Image from sklearn.manifold import TSNE from keras.applications.vgg16 import VGG16, preprocess_input # 加载 VGG16 模型 model = VGG16(weights='imagenet', include_top=False) # 加载图片并进行预处理 img_path = 'pic.jpg' img = Image.open(img_path).resize((224, 224)) x = np.expand_dims(img, axis=0) x = preprocess_input(x) # 提取特征 features = model.predict(x) # 使用 t-SNE 进行特征可视化 tsne = TSNE(n_components=2) features_tsne = tsne.fit_transform(features.reshape(features.shape[0], -1)) # 绘制可视化图像 plt.scatter(features_tsne[:, 0], features_tsne[:, 1]) plt.show() 报错Unresolved reference 'sklearn'Unresolved reference 'TSNE'Unresolved reference 'keras'Unresolved reference 'VGG16'Unresolved reference 'preprocess_input'

这个错误可能是因为你没有安装相关的库，你需要在终端...from sklearn.manifold import TSNE from keras.applications.vgg16 import VGG16, preprocess_input 如果你还遇到错误，请在这里发出来，我会帮你解决。

sklearn tsne

# X_tsne.shape = (n_samples, n_components) In the above code, n_components specifies the number of dimensions in the embedded space (usually set to 2 or 3 for visualization purposes). The ...

sklearn库里的TSNE

X_tsne = tsne.fit_transform(X) # 绘制降维后的数据 plt.scatter(X_tsne[:, 0], X_tsne[:, 1], c=y) plt.show() 在这个示例中，我们加载了鸢尾花数据集，然后创建了一个 TSNE 实例，并将 n_components ...

修改下面代码，另画一张可视化图展示出t_sne里面的数据每15行数据个用一种颜色画出。 import pandas as pd from sklearn import cluster from sklearn import metrics import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.manifold import TSNE from sklearn.decomposition import PCA def k_means(data_set, output_file, png_file, t_labels, score_file, set_name): model = cluster.KMeans(n_clusters=7, max_iter=1000, init="k-means++") model.fit(data_set) # print(list(model.labels_)) p_labels = list(model.labels_) r = pd.concat([data_set, pd.Series(model.labels_, index=data_set.index)], axis=1) r.columns = list(data_set.columns) + [u'聚类类别'] print(r) # r.to_excel(output_file) with open(score_file, "a") as sf: sf.write("By k-means, the f-m_score of " + set_name + " is: " + str(metrics.fowlkes_mallows_score(t_labels, p_labels))+"\n") sf.write("By k-means, the rand_score of " + set_name + " is: " + str(metrics.adjusted_rand_score(t_labels, p_labels))+"\n") '''pca = PCA(n_components=2) pca.fit(data_set) pca_result = pca.transform(data_set) t_sne = pd.DataFrame(pca_result, index=data_set.index)''' t_sne = TSNE() t_sne.fit(data_set) t_sne = pd.DataFrame(t_sne.embedding_, index=data_set.index) plt.rcParams['font.sans-serif'] = ['SimHei'] plt.rcParams['axes.unicode_minus'] = False dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 0] plt.plot(dd[0], dd[1], 'r.') dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 1] plt.plot(dd[0], dd[1], 'go') dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 2] plt.plot(dd[0], dd[1], 'b*') dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 3] plt.plot(dd[0], dd[1], 'o') dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 4] plt.plot(dd[0], dd[1], 'm.') dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 5] plt.plot(dd[0], dd[1], 'co') dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 6] plt.plot(dd[0], dd[1], 'y*') plt.savefig(png_file) plt.clf() '''plt.scatter(data_set.iloc[:, 0], data_set.iloc[:, 1], c=model.labels_) plt.savefig(png_file) plt.clf()''' frog_data = pd.read_csv("D:/PyCharmPython/pythonProject/mfcc3.csv") tLabel = [] for family in frog_data['name']: if family == "A": tLabel.append(0) elif family == "B": tLabel.append(1) elif family == "C": tLabel.append(2) elif family == "D": tLabel.append(3) elif family == "E": tLabel.append(4) elif family == "F": tLabel.append(5) elif family == "G": tLabel.append(6) scoreFile = "D:/PyCharmPython/pythonProject/scoreOfClustering.txt" first_set = frog_data.iloc[:, 1:1327] k_means(first_set, "D:/PyCharmPython/pythonProject/kMeansSet_1.xlsx", "D:/PyCharmPython/pythonProject/kMeansSet_2.png", tLabel, scoreFile, "Set_1")

from sklearn.manifold import TSNE from sklearn.decomposition import PCA def k_means(data_set, output_file, png_file, t_labels, score_file, set_name): model = cluster.KMeans(n_clusters=7, max_iter=...

tsne torch

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python tsne

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tsne pytorch

embedded_data = tsne.fit_transform(data) # 可以对嵌入数据进行可视化或进一步分析 请注意，上述示例中的 your_data.pt 是您自己的数据文件。您需要将其替换为您要执行 t-SNE 分析的实际数据。 希望这能...

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