python读取h5ad文件

要读取h5ad文件，可以使用Python中的`anndata`包。首先需要安装该包，可以使用命令`pip install anndata`进行安装。

读取h5ad文件的步骤如下：

1. 导入`anndata`包：`import anndata as ad`

2. 使用`ad.read_h5ad()`函数读取h5ad文件，将其作为一个对象存储：`data = ad.read_h5ad("filename.h5ad")`，其中`filename.h5ad`为待读取的h5ad文件名。

3. 可以使用`.X`属性获取数据矩阵（即表达矩阵）：`matrix = data.X`。

4. 可以使用`.obs`属性获取观测（样本）的元数据：`metadata = data.obs`。

5. 可以使用`.var`属性获取变量（基因）的元数据：`genes = data.var`。

通过以上步骤，我们可以成功读取h5ad文件，并获取其中的数据矩阵、观测和变量的元数据。