请设计一种编码方式,使有机物能够表示成唯一的python嵌套列表
时间: 2023-06-10 20:06:30 浏览: 114
可以使用SMILES(Simplified Molecular Input Line Entry System)作为有机物的编码方式,并将其转换为嵌套列表。SMILES是一种字符串表示法,用于表示化学分子的结构。
下面是将SMILES转换为嵌套列表的Python代码示例:
```python
import re
def parse_smiles(smiles):
stack = [[]]
for char in smiles:
if char == '(':
stack.append([])
elif char == ')':
sub = stack.pop()
stack[-1].append(sub)
elif char == '[':
match = re.search(r'\[(.*?)\]', smiles)
bracket_content = match.group(1)
stack[-1].append(bracket_content.split('.'))
smiles = smiles[match.end():]
elif char == '.':
pass
else:
stack[-1].append(char)
return stack[0]
```
上述代码中,我们使用栈数据结构来解析SMILES字符串。当遇到左括号时,我们将一个空列表入栈,表示这是一个嵌套列表的开始。当遇到右括号时,我们将栈顶的列表弹出,并将其作为子列表添加到上一个列表中。当遇到方括号时,我们提取方括号内的内容,并将其转换为列表添加到当前列表中。最后,我们返回栈底的列表,即整个嵌套列表的根节点。
例如,对于丙酮(acetone),其SMILES表示为"CC(=O)C",对应的嵌套列表为:
```python
['C', 'C', ['=', 'O'], 'C']
```
注意,由于SMILES字符串中可能包含数字和其他特殊字符,因此在实际使用中需要进行一些额外的处理。此外,由于SMILES并不是一种唯一的表示法,因此可能存在多种嵌套列表表示相同的化学结构。
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