密度聚类python代码

时间: 2023-07-22 21:08:10 浏览: 105
密度聚类算法在Python中的常见实现是DBSCAN(Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise)。以下是一个使用DBSCAN进行密度聚类的示例代码: ```python from sklearn.cluster import DBSCAN import numpy as np # 生成数据 X = np.random.rand(100, 2) # 进行聚类 dbscan = DBSCAN(eps=0.3, min_samples=5).fit(X) # 获取聚类结果 labels = dbscan.labels_ ``` 在上述代码中,首先通过`np.random.rand()`生成一个随机数据集`X`,然后使用DBSCAN进行聚类。在DBSCAN中,`eps`参数表示邻域的半径大小,`min_samples`参数表示一个核心点所需要的邻域内的最小样本数。 聚类结果通过`labels`属性获取,其中每个样本点的标签表示其所属的聚类簇。标签为-1表示该样本被视为噪声点(不属于任何一个聚类簇)。 请注意,具体的参数设置和数据预处理可能需要根据具体问题进行调整。
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人口密度聚类是一种常见的数据分析技术,特别是在地理信息系统(GIS)中,用于将区域划分为基于人口数量的组。在Python中,我们可以使用`geopandas`库结合`sklearn`或`pyspark`等机器学习库来实现这一点。下面是一个简单的例子,使用`scikit-learn`中的DBSCAN算法来进行基于人口密度的点聚类: ```python # 导入必要的库 import geopandas as gpd from shapely.geometry import Point from sklearn.cluster import DBSCAN # 假设你有一个GeoDataFrame 'population_data',其中包含'geometry'列代表地点的几何形状(如Point)和'population'列代表人口数 gdf = gpd.read_file('population_points.shp') # 加载数据 # 将点转化为适合DBSCAN的数据结构 points = [Point(xy) for xy in zip(gdf['longitude'], gdf['latitude'])] # 创建DBSCAN实例,并设置合适的ε(邻域半径)和min_samples(最小样本数) db = DBSCAN(eps=0.5, min_samples=10) # 运行聚类 labels = db.fit_predict(points) # 将标签添加回GeoDataFrame gdf['cluster'] = labels # 可视化结果 gdf.plot(column='cluster', categorical=True)

点密度加权模糊C均值聚类 Python代码

以下是点密度加权模糊C均值聚类的Python代码实现: ```python import numpy as np def distance(p1, p2): return np.sqrt(np.sum(np.square(p1 - p2))) def update_centers(X, U, m): C = [] for j in range(m): numerator = 0 denominator = 0 for i in range(len(X)): numerator += (U[i][j] ** 2) * X[i] denominator += U[i][j] ** 2 C.append(numerator / denominator) return C def update_memberships(X, C, m, p): U = np.zeros((len(X), m)) for i in range(len(X)): for j in range(m): dist = distance(X[i], C[j]) if dist == 0: U[i][j] = 1 else: numerator = dist ** (2 / (p - 1)) denominator = 0 for k in range(m): denominator += (distance(X[i], C[k]) ** (2 / (p - 1))) U[i][j] = 1 / (numerator / denominator) return U def density_weights(X): D = [] for i in range(len(X)): density = 0 for j in range(len(X)): if i != j: density += 1 / distance(X[i], X[j]) D.append(density) return D def pdw_fcm(X, m, p, max_iter=100, error=1e-5): D = density_weights(X) U = np.random.rand(len(X), m) U = U / np.sum(U, axis=1)[:, None] err = 1e10 iter = 0 while err > error and iter < max_iter: C = update_centers(X, U, m) U_new = update_memberships(X, C, m, p) D_new = density_weights(X) U_new = U_new * (D_new / D)[:, None] U_new = U_new / np.sum(U_new, axis=1)[:, None] err = np.linalg.norm(U_new - U) U = U_new iter += 1 return U, C ``` 其中,`X`是数据点的集合,`m`是聚类的个数,`p`是模糊指数,`max_iter`是最大迭代次数,`error`是聚类误差。函数返回聚类结果的隶属度矩阵`U`和聚类中心`C`。
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