forest plot python
时间: 2024-11-13 19:00:37 浏览: 17
Forest plot是一种数据可视化技术,通常用于医学研究中的元分析结果展示,它通过并排放置不同研究之间的效应量估计(如平均差异、风险比等),以及它们的可信区间,以便于比较和理解各研究结果间的异同。在Python中,可以使用`seaborn`库中的`forestplot()`函数来创建森林图。
以下是一个简单的步骤示例:
```python
import seaborn as sns
import numpy as np
import pandas as pd
# 假设我们有一个包含效应量、置信区间的DataFrame
data = {
'Study': ['A', 'B', 'C', 'D'],
'Effect': [0.8, -0.5, 1.2, 0.3],
'Lower_CI': [-0.2, -0.7, 0.9, 0.1],
'Upper_CI': [1.6, -0.3, 1.5, 0.4]
}
df = pd.DataFrame(data)
# 创建森林图
sns.set_theme(style="whitegrid")
g = sns.catplot(
data=df,
x="Study",
y="Effect",
hue="Study",
ci='sd',
kind="point",
height=4,
aspect=.75,
capsize=.2,
palette="Set3"
)
g.axhline(0, color=".6", linewidth=1) # 添加一条零线
g.despine(left=True)
```
这个例子假设每个"Study"都是一个独立的研究,"Effect"是效应大小,"Lower_CI"和"Upper_CI"是对应的置信区间。通过设置不同的颜色和样式,可以清晰地对比各个研究的结果。
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