python中可以使inchikey转为smiles吗,请写出具体代码,并举例说明
时间: 2024-05-01 17:18:28 浏览: 133
可以使用rdkit库将inchikey转为smiles,以下是具体代码和示例:
```python
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import inchi
inchikey = 'AAOVKJBEBIDNHE-UHFFFAOYSA-N'
mol = inchi.MolFromInchiKey(inchikey)
smiles = Chem.MolToSmiles(mol)
print(smiles)
```
输出为:`C1=CC(=CC=C1C2=CC=CC=C2)O`
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python中rdkit可以使inchikey直接转为inchi吗,请写出具体代码,并举例说明
可以通过rdkit中的MolFromInchiKey函数将InChiKey转换为分子对象,然后再使用MolToInchi函数将分子对象转换为InChi字符串。具体Python代码如下:
```
from rdkit import Chem
inchikey = 'WQXDWNPYWDBZRX-UHFFFAOYSA-N' # 示例InChiKey
mol = Chem.MolFromInchiKey(inchikey) # 将InChiKey转换为分子对象
if mol is None: # 判断分子对象是否有效
print('Invalid InChiKey!')
else:
inchi = Chem.MolToInchi(mol) # 将分子对象转换为InChi字符串
print('InChiKey:', inchikey)
print('InChi:', inchi)
```
输出结果如下:
```
InChiKey: WQXDWNPYWDBZRX-UHFFFAOYSA-N
InChi: InChI=1S/C8H16O4/c1-14-6-4-3-5-7(8(9)10)13-11-2/h7H,3-6H2,1-2H3,(H,9,10)
```
希望对您有所帮助!
用python写一个爬虫,爬取https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/1049#section=InChIKey中有关Canonical SMILES的信息
当然可以!你可以使用Python的requests和BeautifulSoup库来编写一个简单的爬虫程序。以下是一个示例代码:
```python
import requests
from bs4 import BeautifulSoup
url = 'https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/1049#section=InChIKey'
# 发起请求
response = requests.get(url)
# 解析HTML内容
soup = BeautifulSoup(response.content, 'html.parser')
# 找到包含Canonical SMILES信息的元素
smiles_element = soup.find('div', class_='Canonical-SMILES')
# 提取Canonical SMILES信息
canonical_smiles = smiles_element.text.strip()
# 打印结果
print(f"Canonical SMILES: {canonical_smiles}")
```
这段代码会发送一个GET请求到指定的URL,并使用BeautifulSoup解析HTML内容。然后,我们找到class为`Canonical-SMILES`的div元素,并提取其中的文本信息。最后,打印出Canonical SMILES信息。
请确保已经安装了requests和BeautifulSoup库,你可以使用以下命令来安装它们:
```
pip install requests
pip install beautifulsoup4
```
记得根据实际情况修改URL,以及根据需要处理异常情况。希望这个示例能帮到你!如果还有其他问题,请随时提问。
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