IMCDriver预测算法如何在top-N排序方法上计算精确度,预测的驱动基因数小于N,因此我们复制了最后一个Precision、Recall、F1-Score评分,使所有癌症数据集的指标评分数等于N。如果N=30,在30个预测结果中,预测到的驱动基因数为10,实际真实驱动基因数为15,请详细举例说明并计算精确度,召回率、F1-Score评分
时间: 2023-06-19 16:06:30 浏览: 114
在这种情况下,我们需要将预测结果按照其得分进行排序,并选择前30个结果。假设预测结果中排名前10的基因确实是驱动基因,那么我们将其视为真阳性(True Positive, TP)。而剩下的20个预测结果中,可能有一些也是驱动基因,但我们无法判断其真实性,因此将其视为假阳性(False Positive, FP)。实际上,我们知道这个数据集中有15个真实的驱动基因,因此将其视为真实阳性(True Positive, TP),而剩下的5个基因则视为假阴性(False Negative, FN)。
精确度(Precision)指的是预测为真的结果中,真实的结果所占的比例,即:
$$ Precision = \frac{TP}{TP+FP} $$
在这个例子中,$TP=10$,$FP=20$,因此:
$$ Precision = \frac{10}{10+20} = 0.3333 $$
召回率(Recall)指的是真实的结果中,被预测为真的结果所占的比例,即:
$$ Recall = \frac{TP}{TP+FN} $$
在这个例子中,$TP=10$,$FN=15-10=5$,因此:
$$ Recall = \frac{10}{10+5} = 0.6667 $$
F1-Score 综合了精确度和召回率的评分,它是精确度和召回率的调和平均数。具体计算方法为:
$$ F1 = 2 \times \frac{Precision \times Recall}{Precision + Recall} $$
将上面计算出来的精确度和召回率代入上式,得到:
$$ F1 = 2 \times \frac{0.3333 \times 0.6667}{0.3333 + 0.6667} = 0.4444 $$
因此,预测结果的精确度为 0.3333,召回率为 0.6667,F1-Score 为 0.4444。这些评分可以用来衡量 IMCDriver 预测算法的性能。
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