怎么看survreg函数的输出
时间: 2024-03-11 11:44:28 浏览: 184
survreg函数的输出包含了生存模型的各种参数和统计信息。下面是一些常见的输出和它们的含义:
1. Coefficients:模型的系数(包括截距项和各个自变量的系数)。
2. Log Likelihood:对数似然值,表示该模型对观测数据的拟合程度。
3. Scale:比例因子,表示模型的误差方差。
4. Iterations:迭代次数,表示模型的迭代次数。
5. AIC:赤池信息准则,表示该模型在给定数据下的拟合程度和模型复杂度的平衡。
6. BIC:贝叶斯信息准则,与AIC类似,但考虑了样本量和模型复杂度的惩罚项。
7. Concordance:一致性指数,表示模型对数据的预测能力。
8. Likelihood ratio test:似然比检验,用于比较两个模型的拟合程度。
你还可以通过summary()函数来查看survreg函数的输出。summary()函数提供了更详细的信息,如标准误差、置信区间和p值等。
相关问题
weibull_model <- survreg(Surv(days, cens) ~ arms + cd40 + age + wtkg + homo + race + gender, data = data, dist = "weibull"),这是原模型,要求保留variable,做一个上面说的模型
根据您的要求,我们需要将 Weibull 模型转化为 Cox Frailty Model,同时保留所有的变量。下面是一个示例代码:
```R
library(survival)
library(coxme)
# 读取数据
data <- read.csv("data.csv")
# 拟合 Cox Frailty Model
cox_model <- coxme(Surv(days, cens) ~ arms + cd40 + age + wtkg + homo + race + gender + (1 | frailty), data = data)
# 查看模型摘要
summary(cox_model)
# 计算 Hazard Ratio 和 95% CI
HR <- exp(coef(cox_model)["treatment"])
CI <- exp(confint(cox_model)["treatment", ])
# 输出结果
cat("Hazard Ratio (95% CI):", round(HR, 2), "(", round(CI[1], 2), "-", round(CI[2], 2), ")")
```
在这个代码中,我们使用了 survreg() 函数拟合了一个 Weibull 模型。然后,我们使用 coxme() 函数将其转化为 Cox Frailty Model。在公式中,我们指定了时间和事件状态作为响应变量,以及所有的解释变量。我们还使用了 "(1 | frailty)" 来指定 Frailty 随机截距项。
在计算 Hazard Ratio 和 95% CI 时,我们使用了 coef() 函数来提取回归系数,使用 confint() 函数来计算置信区间。最后,我们使用 cat() 函数来将结果输出。
请注意,这只是一个 Cox Frailty Model 的示例代码,具体的代码和模型设置可能会因研究问题而异。
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