ubuntu配置openmpi编译器
时间: 2023-11-09 08:58:01 浏览: 42
要在Ubuntu上配置OpenMPI编译器,您需要安装libhdf5-openmpi-dev软件包。可以使用以下命令进行安装:
sudo apt-get install libhdf5-openmpi-dev
这将安装OpenMPI的开发库,以便您可以使用它来编译OpenFOAM和HDF5。
如果您遇到配置错误,并出现"C preprocessor "/lib/cpp" fails sanity"的错误消息,这可能是由于C编译器的相关包未安装。您可以使用以下命令来安装相关包:
sudo apt-get install build-essential
这将安装C编译器的相关包,解决配置错误。
在回答您的问题之后,我提供几个相关问题:
相关问题:
1. 如何在Ubuntu上安装OpenFOAM?
2. 如何在Ubuntu上安装HDF5库?
3. OpenMPI和MPICH之间有什么区别?
相关问题
openmpi windows
Open MPI是一个开源的消息传递接口(Message Passing Interface)库,用于并行计算和高性能计算。它允许多个进程在不同的计算节点上进行通信和协作。
在Windows系统上使用Open MPI可以有几种选择:
1. 使用Cygwin:Cygwin是一个在Windows上运行类Unix环境的开源工具集,它可以提供类Unix的shell环境和GNU工具链。你可以通过Cygwin安装Open MPI,并在Cygwin终端中编译和运行基于Open MPI的程序。
2. 使用WSL(Windows Subsystem for Linux):WSL是Windows 10中提供的一种功能,它允许你在Windows上运行Linux发行版。你可以安装一个Linux发行版(如Ubuntu)并在WSL中安装Open MPI来进行开发和运行。
3. 使用MS-MPI:MS-MPI是由Microsoft提供的一种用于Windows系统的MPI实现,它与Windows HPC Server相集成。你可以下载并安装MS-MPI,然后使用它来编译和运行基于MPI的程序。
无论选择哪种方法,你都需要确保已经安装了编译器(如GCC或Clang)以及Open MPI库。具体的安装和配置步骤可以参考相关的文档和教程。
ubuntu20.04安装chemshell
在Ubuntu 20.04上安装ChemShell的过程与上面所述的基本相同,只是需要安装一些依赖项。
以下是在Ubuntu 20.04上安装ChemShell的步骤:
1. 打开终端,并输入以下命令安装必要的依赖项:
```
sudo apt-get update
sudo apt-get install gfortran liblapack-dev libblas-dev libxml2-dev libxslt1-dev libopenmpi-dev openmpi-bin
```
2. 下载最新的ChemShell安装包,并解压缩:
```
tar -xzvf chemshell-x.x.tar.gz
```
3. 进入解压后的ChemShell目录,运行安装脚本:
```
cd chemshell-x.x
./install.sh
```
4. 根据提示选择安装选项,如选择安装路径、编译器等。
5. 设置环境变量:
在用户的.bashrc文件中添加以下行:
```
export CHEMSHELL_HOME=/path/to/chemshell
export PATH=$PATH:$CHEMSHELL_HOME/bin
```
其中,/path/to/chemshell是ChemShell的安装路径。
6. 重新打开终端或运行以下命令使环境变量生效:
```
source ~/.bashrc
```
安装完成后,可以通过运行以下命令来检查ChemShell是否正确安装:
```
chemsh-version
```
如果显示版本号,则表示安装成功。