如何在Python的pandas库中读取xlsx文件并按行列取值？

在Python中，你可以使用pandas库方便地读取和操作Excel (xlsx) 文件。以下是如何通过pandas来按行列取值的基本步骤：

1. 首先，你需要安装`openpyxl`或`xlrd`库，它们用于处理不同版本的Excel文件：

   pip install pandas openpyxl # 或者 xlrd (适用于较早版本的Excel)

2. 然后，使用`pandas.read_excel()`函数读取文件：

   import pandas as pd
   df = pd.read_excel('file.xlsx') # 将'file.xlsx'替换为你实际的文件路径

3. 要按行列取值，你可以直接通过列名（字符串）或索引（整数）访问数据。例如，获取第3列（索引为2）的全部行数据：

   column_3_data = df['Column3']

或者获取第5行的全部列数据：

   row_5_data = df.iloc[4]  # 使用iloc，注意索引是从0开始的

4. 如果你想获取一个具体的子区域，可以组合行索引和列索引：

   sub_df = df.iloc[3:6, 1:3]  # 选取第4到6行，第1到2列的数据

记得把上面的'Column3', 'Row5', 'Column1:Column2'等替换为你的实际列名或行索引。

相关问题

B行的数字都是整数，取值范围是1到30；C行的数字都是小数，取值范围是0.001到0.999。B行的数字都是从小到大排列的。 在保证准确率的前提下优化下面的程序。 ''' import pandas as pd # 读取两个 Excel 文件 df1 = pd.read_excel("1.xlsx") df2 = pd.read_excel("2.xlsx") # 定义输出 Dataframe output_df = pd.DataFrame(columns=["B", "C"]) # 遍历 df1 中的每一行，比较 B 和 C 列的数值是否与 df2 中相同 for index1, row1 in df1.iterrows(): for index2, row2 in df2.iterrows(): if row1["B"] == row2["B"] and row1["C"] == row2["C"]: # 如果 B 和 C 的数值相同，则将它们追加到 output_df 中，并跳出内层循环以继续处理下一行 output_df.loc[len(output_df)] = [row1["B"], row1["C"]] break # 保存输出 Excel 文件 output_df.to_excel("3.xlsx", index=False) '''

在代码中使用了两个嵌套的for循环，时间复杂度较高。可以考虑使用merge函数进行合并，然后筛选出符合条件的数据。代码示例如下：

import pandas as pd

# 读取两个 Excel 文件
df1 = pd.read_excel("1.xlsx")
df2 = pd.read_excel("2.xlsx")

# 使用merge函数进行合并
merged_df = pd.merge(df1, df2, on=["B", "C"])

# 筛选出符合条件的数据
output_df = merged_df[["B", "C"]]

# 保存输出 Excel 文件
output_df.to_excel("3.xlsx", index=False)

这样可以避免使用嵌套循环，提高程序的效率。同时，使用merge函数进行合并也可以避免出现重复的数据。

python 根据文件“Molecular_Descriptor.xlsx”和“ERα_activity.xlsx”提供的数据，针对1974个化合物的729个分子描述符进行变量选择，根据变量对生物活性影响的重要性进行排序，并给出前20个对生物活性最具有显著影响的分子描述符（即变量），并请详细说明分子描述符筛选过程及其合理性。 问题2. 请结合问题1，选择不超过20个分子描述符变量，构建化合物对ERα生物活性的定量预测模型，请叙述建模过程。然后使用构建的预测模型，对文件“ERα_activity.xlsx”的test表中的50个化合物进行IC50值和对应的pIC50值预测，并将结果分别填入“ERα_activity.xlsx”的test表中的IC50_nM列及对应的pIC50列。 问题3. 请利用文件“Molecular_Descriptor.xlsx”提供的729个分子描述符，针对文件“ADMET.xlsx”中提供的1974个化合物的ADMET数据，从五个指标（Caco-2、CYP3A4、hERG、HOB、MN）中任选2个，分别构建其分类预测模型，并简要叙述建模过程。然后使用所构建的2个分类预测模型，对文件“ADMET.xlsx”的test表中的50个化合物进行相应的预测，并将结果填入“ADMET.xlsx”的test表中对应的Caco-2、CYP3A4、hERG、HOB、MN列。 问题4（选做）. 寻找并阐述化合物的哪些分子描述符，以及这些分子描述符在什么取值或者处于什么取值范围时，能够使化合物对抑制ERα具有更好的生物活性，同时具有更好的ADMET性质（给定的五个ADMET性质中，至少三个性质较好）。

问题2：根据前20个对生物活性最具有显著影响的分子描述符，构建化合物对ERα生物活性的定量预测模型

根据问题1中的结果，我们选取前20个对生物活性最具有显著影响的分子描述符作为特征，使用线性回归算法构建化合物对ERα生物活性的定量预测模型。具体的建模过程如下：

from sklearn.linear_model import LinearRegression
from sklearn.metrics import mean_squared_error, r2_score

# 读取数据文件
df_mol = pd.read_excel('Molecular_Descriptor.xlsx', sheet_name='training')
df_er = pd.read_excel('ERα_activity.xlsx', sheet_name='training')
df_test = pd.read_excel('ERα_activity.xlsx', sheet_name='test')

# 合并数据
df = pd.merge(df_mol, df_er, on='Molecule')

# 数据预处理
df = df.drop(columns=['Molecule'])
df = df.dropna()

# 特征工程
X_train = df.iloc[:, indices[:20]]
y_train = df.iloc[:, -1]
X_test = df_test.iloc[:, indices[:20]]

# 训练模型
reg = LinearRegression()
reg.fit(X_train, y_train)

# 预测结果
y_pred = reg.predict(X_test)

# 将预测结果写入文件
df_test['IC50_nM'] = y_pred
df_test['pIC50'] = -np.log10(y_pred / 1e9)
df_test.to_excel('ERα_activity.xlsx', sheet_name='test', index=False)

代码执行过程中，首先使用pandas库读取数据文件，并将分子描述符和生物活性数据进行合并。然后进行数据预处理，删除无效数据。接着进行特征工程，选取前20个对生物活性最具有显著影响的分子描述符作为特征。然后使用线性回归算法对模型进行训练，并使用训练好的模型对测试集中的化合物进行预测。最后将预测结果写入文件中。

问题3：利用分子描述符构建ADMET分类预测模型

在Python中，可以使用机器学习算法对分子描述符进行分类预测。这里我们选择决策树算法和支持向量机算法，分别对Caco-2和CYP3A4两个指标进行分类预测。

以下是具体的代码实现步骤：

from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier
from sklearn.svm import SVC
from sklearn.metrics import accuracy_score

# 读取数据文件
df_mol = pd.read_excel('Molecular_Descriptor.xlsx', sheet_name='training')
df_admet = pd.read_excel('ADMET.xlsx', sheet_name='training')
df_test = pd.read_excel('ADMET.xlsx', sheet_name='test')

# 合并数据
df = pd.merge(df_mol, df_admet, on='Molecule')

# 数据预处理
df = df.drop(columns=['Molecule'])
df = df.dropna()

# 特征工程
X_train = df.iloc[:, :-5]
y_caco2_train = df.iloc[:, -5]
y_cyp3a4_train = df.iloc[:, -4]

# 分类预测模型
# Caco-2预测模型
clf_caco2 = DecisionTreeClassifier(random_state=42)
clf_caco2.fit(X_train, y_caco2_train)

# CYP3A4预测模型
clf_cyp3a4 = SVC(random_state=42)
clf_cyp3a4.fit(X_train, y_cyp3a4_train)

# 预测结果
X_test = df_test.iloc[:, :-5]
y_caco2_pred = clf_caco2.predict(X_test)
y_cyp3a4_pred = clf_cyp3a4.predict(X_test)

# 将预测结果写入文件
df_test['Caco-2'] = y_caco2_pred
df_test['CYP3A4'] = y_cyp3a4_pred
df_test.to_excel('ADMET.xlsx', sheet_name='test', index=False)

代码执行过程中，首先使用pandas库读取数据文件，并将分子描述符和ADMET数据进行合并。然后进行数据预处理，删除无效数据。接着进行特征工程，将分子描述符作为特征，将Caco-2和CYP3A4指标作为标签。然后选择决策树算法和支持向量机算法，分别对Caco-2和CYP3A4两个指标进行分类预测。最后将预测结果写入文件中。

问题4：寻找具有更好生物活性和ADMET性质的分子描述符

为了寻找具有更好生物活性和ADMET性质的分子描述符，可以使用统计方法和机器学习算法对数据进行分析和建模。具体的方法包括但不限于：相关性分析、主成分分析、逻辑回归等。

在具体分析过程中，需要先确定具体的分析目标和指标，然后根据数据特征和分析方法进行数据预处理和特征工程。最后选取合适的算法进行建模和分析，得出具有更好生物活性和ADMET性质的分子描述符。