matlab实现原子轨道搜索算法

时间: 2023-07-13 09:04:48 浏览: 56
原子轨道搜索算法是一种基于密度泛函理论的计算方法,用于求解原子的电子结构。Matlab可以通过调用第三方库,如VASP和ABINIT等软件包来实现该算法,也可以使用自己编写的程序实现。 以下是一个使用Matlab编写的原子轨道搜索算法的简单实现过程: 1. 定义原子结构和计算参数 ``` a = 6.0; %晶格常数 atom_pos = [0,0,0]; %原子位置 ngrid = 64; %网格数 cutoff = 300; %动能截断 ``` 2. 生成交换相关势 ``` rho = zeros(ngrid,ngrid,ngrid); %电荷密度 vxc = zeros(ngrid,ngrid,ngrid); %交换相关势 %计算电荷密度 for i = 1:ngrid for j = 1:ngrid for k = 1:ngrid r = sqrt((i-ngrid/2)^2 + (j-ngrid/2)^2 + (k-ngrid/2)^2); if r < a/2 rho(i,j,k) = 1; end end end end %计算交换相关势 vxc = v_xc(rho); ``` 3. 计算Kohn-Sham方程 ``` %初始化势能矩阵 v_pot = zeros(ngrid,ngrid,ngrid); %迭代求解Kohn-Sham方程 for iter = 1:100 %定义哈密顿矩阵 ham = -1/2 * laplacian3d(ngrid) + diag(v_pot(:)) + diag(vxc(:)); %求解本征值和本征向量 [eigvec,eigval] = eigs(ham,cutoff); %更新电荷密度和势能 rho_new = 2 * sum(abs(eigvec).^2,2); v_pot_new = coulomb_potential(rho_new); %计算误差 err = max(abs(rho_new(:) - rho(:))); %判断是否收敛 if err < 1e-8 break; end %更新电荷密度和势能 rho = rho_new; v_pot = v_pot_new; end %计算轨道 orbitals = eigvec(:,1:10); ``` 4. 可视化结果 ``` %绘制电荷密度和轨道 isosurface(rho,0.1); hold on; for i = 1:10 orb = reshape(orbitals(:,i),[ngrid,ngrid,ngrid]); isosurface(abs(orb).^2,0.1); end ``` 以上是一个简单的原子轨道搜索算法的Matlab实现。在实际应用中,需要结合具体问题进行调整和优化。

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