R语言进行GBD数据库发病率死亡率DALY及其95%UI计算

在R语言中，Global Burden of Disease (GBD) 数据库通常包含关于全球疾病负担的各种统计信息，包括发病率、死亡率和 Disability Adjusted Life Years (DALYs，即伤残调整生命年数，用于衡量健康损失）。GBD 计算涉及到复杂的流行病学模型和数据处理。

要计算 GBD 中的发病率、死亡率和 DALYs 及其95%置信区间，你可以使用官方提供的`gbpsr`包（Global Burden of Disease Study Results R Package），它提供了方便的数据接口和预定义函数来进行这些分析。以下是基本步骤：

1. **安装与加载**:

   install.packages("gbpsr")
   library(gbpsr)

2. **加载GBD数据**:
使用`get_GBD_data()`获取最新的GBD数据集，这可能需要一些时间下载和解压数据：

   data <- get_GBD_data(year = 2019, age_group = c("all"), sex = "both", location = "global")

3. **计算发病率（Incidence）、死亡率(Mortality)和DALYs**:

   incidence <- data$incidence
   mortality <- data$mortality
   dalys <- data$dalys

4. **计算95%置信区间（CI）**:
这些数据一般已经包含了置信区间的计算。如果需要手动计算，可以参考`summary()`函数的结果或使用`confint()`函数对特定变量求置信区间。

ci_dalys <- confint(dalys)

5. **可视化结果**:
使用`ggplot2`等图形库将结果可视化展示出来。

library(ggplot2)
dalys_plot <- ggplot(data.frame(year = 2019, dalys = dalys), aes(x = year, y = dalys)) + geom_line()
ci_lines <- data.frame(year = 2019, lower = ci_dalys[1,], upper = ci_dalys[2,])
dalys_plot + geom_ribbon(aes(ymin = lower, ymax = upper), fill = "lightblue") + geom_line(data = ci_lines, color = "red", linetype = "dashed")