调用networkx包生成一个LFR网络
时间: 2024-09-29 09:04:48 浏览: 58
NetworkX是一个强大的Python库,用于处理各种复杂网络数据结构。LFR( Lancichinetti-Fortunato-Radicchi)网络是一种常用于研究社区结构的随机图模型。要使用`networkx`生成一个LFR网络,你需要先安装这个库(如果还没有的话),然后可以按照以下步骤操作:
1. **安装**:确保已经安装了`networkx`,如果没有,可以通过`pip install networkx`来安装。
2. **导入所需模块**:
```python
import networkx as nx
import numpy as np
from collections import defaultdict
```
3. **设置LFR参数**:
- `n`:网络中的节点数。
- `m`:平均度数。
- `mu`:最大度数与最小度数的比例。
- `gamma`:社区大小分布的幂律指数。
- `beta`:连接内部节点的概率比连接外部节点的概率高出的倍数。
- `seed`:随机数种子,用于复现结果。
4. **生成LFR网络**:
```python
def generate_lfr_graph(n, m, mu, gamma, beta, seed=0):
np.random.seed(seed)
# 设置参数
max_degree = int(np.round(mu * m))
min_degree = int(max_degree / (mu + 1))
k_avg = (max_degree + min_degree) / 2
avg_community_size = n / gamma
# 初始化网络
G = nx.Graph()
# 创建节点及其社区标签
node_degrees = {i: [min_degree] for i in range(n)}
communities = defaultdict(list)
# 添加节点并链接
for _ in range(m * n):
# 随机选择一个节点
u = np.random.choice(G.nodes())
# 决定连接到现有节点还是新节点
if np.random.rand() < beta:
v = u
else:
while True:
v = np.random.choice([node for node, degree in node_degrees.items() if degree[0] < k_avg])
# 如果v已经是u的邻居,则尝试新节点
if not G.has_edge(u, v):
break
# 更新节点度数
node_degrees[u].append(minDegree)
node_degrees[v].append(minDegree)
G.add_edge(u, v)
# 根据社区大小分布分配节点
community_sizes = sorted(np.random.poisson(avg_community_size, n).tolist(), reverse=True)
for size, node in zip(community_sizes, range(n)):
communities[size].append(node)
nx.set_node_attributes(G, 'community', communities)
return G
# 示例
G = generate_lfr_graph(1000, 5, 2, 2, 1.5, seed=42)
```
这将生成一个LFR网络,你可以通过查看`G`变量来观察其结构。记得调整参数以适应你的需求。
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