parentdir = os.path.dirname(os.path.dirname(os.path.abspath(__file__)))
时间: 2024-03-06 12:43:40 浏览: 145
`parentdir = os.path.dirname(os.path.dirname(os.path.abspath(__file__)))` 这行代码的作用是获取当前文件的父目录的路径。
这行代码可以分解为以下几个步骤:
1. `os.path.abspath(__file__)`:获取当前文件的绝对路径。
2. `os.path.dirname(os.path.abspath(__file__))`:获取当前文件所在目录的路径。
3. `os.path.dirname(os.path.dirname(os.path.abspath(__file__)))`:获取当前文件所在目录的父目录的路径。
这样,`parentdir` 就是当前文件的父目录的路径。
范例:
```python
import os
# 获取当前文件的父目录的路径
parentdir = os.path.dirname(os.path.dirname(os.path.abspath(__file__)))
print(parentdir) # 输出父目录的路径
```
输出结果:
```
/home/user/project
```
相关问题
parentdir = 'F:\data process\fMRI\fmrioutput'; % 定义储存各被试源文件的上级文件夹 cd(parentdir); % 进入这个上级文件夹 allsubjects = dir('sub*');%查找该文件夹下的所有被试 subinfos = numel(allsubjects); for i=1:numel(allsubjects) % 对每个被试进行循环 cursubject = allsubjects(i).name; % 找到当前被试的名字 matlabbatch=cell(1); curWPAT = fullfile(parentdir,cursubject,'WPAT'); curfucout=fullfile('F:\data process\fMRI\fmrioutput',cursubject,'WPAT') matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.dir = {curfucout}; a=curWPAT('sw*nii',curfucout); matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.timing.units = 'scans'; matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.timing.RT = 2; matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.timing.fmri_t = 16; matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.timing.fmri_t0 = 8;怎么改
这段代码可能存在一些错误,不过我尝试理解你的意图,以下是我对代码的修改建议:
```
parentdir = 'F:\data process\fMRI\fmrioutput'; % 定义储存各被试源文件的上级文件夹
cd(parentdir); % 进入这个上级文件夹
allsubjects = dir('sub*'); % 查找该文件夹下的所有被试
subinfos = numel(allsubjects);
for i = 1:numel(allsubjects) % 对每个被试进行循环
cursubject = allsubjects(i).name; % 找到当前被试的名字
curWPAT = fullfile(parentdir, cursubject, 'WPAT');
curfucout = fullfile(parentdir, cursubject, 'WPAT');
matlabbatch = struct('spm', struct('stats', struct('fmri_spec', struct())));
% 设置输出路径
matlabbatch.spm.stats.fmri_spec.dir = {curfucout};
% 加载数据
matlabbatch.spm.stats.fmri_spec.sess.scans = cellstr(spm_select('ExtFPList', curWPAT, '^sw.*\.nii$', Inf));
% 设置时间信息
matlabbatch.spm.stats.fmri_spec.timing.units = 'scans';
matlabbatch.spm.stats.fmri_spec.timing.RT = 2;
matlabbatch.spm.stats.fmri_spec.timing.fmri_t = 16;
matlabbatch.spm.stats.fmri_spec.timing.fmri_t0 = 8;
end
```
主要的修改包括:
1. 修改了输出路径的定义,将 `curfucout` 赋值给了 `curfucout`。
2. 加入了加载数据的代码,使用 `spm_select` 函数来选择该被试的所有 sw.nii 文件。
3. 修改了 `matlabbatch` 的定义方式,使用了结构体嵌套的方式。
这样你就可以使用 `matlabbatch` 变量来进行后续的 fMRI 分析流程了。
clear;clc parentdir = 'F:\data process\fMRI\fmrioutput'; % 定义储存各被试源文件的上级文件夹 cd(parentdir); % 进入这个上级文件夹 allsubjects = dir('sub*');%查找该文件夹下的所有被试 subinfos = numel(allsubjects); for i=1:numel(allsubjects) % 对每个被试进行循环 cursubject = allsubjects(i).name; % 找到当前被试的名字 matlabbatch=cell(1); curWPAT = fullfile(parentdir,cursubject,'WPAT'); curfucout=fullfile('F:\data process\fMRI\fmrioutput',cursubject,'WPAT') matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.dir = {curfucout}; matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.sess.scans = cellstr(spm_select('ExtFPList', curWPAT, '^sw*.nii', Inf)) matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.timing.units = 'scans'; matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.timing.RT = 2; matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.timing.fmri_t = 16; matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.timing.fmri_t0 = 8; %% matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.sess.cond = struct('name', {}, 'onset', {}, 'duration', {}, 'tmod', {}, 'pmod', {}, 'orth', {}); matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.sess.multi = {'D:\data process\fMRI\onsets\subject(i)_run1.mat'}; matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.sess.regress = struct('name', {}, 'val', {}); matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.sess.tempxx=dir(fullfile(curfucout,'rp*.txt')) matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.sess.hpf = 128; matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.fact = struct('name', {}, 'levels', {}); matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.bases.hrf.derivs = [0 0]; matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.volt = 1; matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.global = 'None'; matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.mthresh = 0.8; matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.mask = {''}; matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.cvi = 'AR(1)'; matlabbatch{2}.spm.stats.fmri_est.spmmat(1) = cfg_dep('fMRI model specification: SPM.mat File', substruct('.','val', '{}',{1}, '.','val', '{}',{1}, '.','val', '{}',{1}), substruct('.','spmmat')); matlabbatch{2}.spm.stats.fmri_est.write_residuals = 0; matlabbatch{2}.spm.stats.fmri_est.method.Classical = 1; matlabbatch{3}.spm.stats.con.spmmat(1) = cfg_dep('Model estimation: SPM.mat File', substruct('.','val', '{}',{2}, '.','val', '{}',{1}, '.','val', '{}',{1}), substruct('.','spmmat')); matlabbatch{3}.spm.stats.con.consess{1}.tcon.name = 'Old'; matlabbatch{3}.spm.stats.con.consess{1}.tcon.weights = 1; matlabbatch{3}.spm.stats.con.consess{1}.tcon.sessrep = 'none'; matlabbatch{3}.spm.stats.con.delete = 0; end;怎么改
这段代码有几个语法错误,你可以试着按照下面的修改来运行:
```matlab
clear;clc;
parentdir = 'F:\data process\fMRI\fmrioutput'; % 定义储存各被试源文件的上级文件夹
cd(parentdir); % 进入这个上级文件夹
allsubjects = dir('sub*');%查找该文件夹下的所有被试
subinfos = numel(allsubjects);
for i=1:numel(allsubjects) % 对每个被试进行循环
cursubject = allsubjects(i).name; % 找到当前被试的名字
matlabbatch=cell(1);
curWPAT = fullfile(parentdir,cursubject,'WPAT');
curfucout=fullfile('F:\data process\fMRI\fmrioutput',cursubject,'WPAT');
matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.dir = {curfucout};
matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.sess.scans = cellstr(spm_select('ExtFPList', curWPAT, '^sw*.nii', Inf));
matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.timing.units = 'scans';
matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.timing.RT = 2;
matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.timing.fmri_t = 16;
matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.timing.fmri_t0 = 8;
%matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.sess.cond = struct('name', {}, 'onset', {}, 'duration', {}, 'tmod', {}, 'pmod', {}, 'orth', {});
matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.sess.multi = {['D:\data process\fMRI\onsets\' cursubject '_run1.mat']};
matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.sess.regress = struct('name', {}, 'val', {});
matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.sess.tempxx=dir(fullfile(curfucout,'rp*.txt'));
matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.sess.hpf = 128;
matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.fact = struct('name', {}, 'levels', {});
matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.bases.hrf.derivs = [0 0];
matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.volt = 1;
matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.global = 'None';
matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.mthresh = 0.8;
matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.mask = {''};
matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.cvi = 'AR(1)';
matlabbatch{2}.spm.stats.fmri_est.spmmat(1) = cfg_dep('fMRI model specification: SPM.mat File', substruct('.','val', '{}',{1}, '.','val', '{}',{1}, '.','val', '{}',{1}), substruct('.','spmmat'));
matlabbatch{2}.spm.stats.fmri_est.write_residuals = 0;
matlabbatch{2}.spm.stats.fmri_est.method.Classical = 1;
matlabbatch{3}.spm.stats.con.spmmat(1) = cfg_dep('Model estimation: SPM.mat File', substruct('.','val', '{}',{2}, '.','val', '{}',{1}, '.','val', '{}',{1}), substruct('.','spmmat'));
matlabbatch{3}.spm.stats.con.consess{1}.tcon.name = 'Old';
matlabbatch{3}.spm.stats.con.consess{1}.tcon.weights = 1;
matlabbatch{3}.spm.stats.con.consess{1}.tcon.sessrep = 'none';
matlabbatch{3}.spm.stats.con.delete = 0;
spm_jobman('run',matlabbatch);
end
```
主要的修改如下:
1. 在 `curfucout` 赋值语句的末尾加上分号;
2. 在 `matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.sess.multi` 赋值语句中,使用字符串拼接的方式来生成文件路径;
3. 在 `matlabbatch{1}.spm.stats.fmri_spec.sess.tempxx` 赋值语句中,使用 `dir` 函数来列出相关文件;
4. 最后添加了一个 `spm_jobman` 函数来运行 `matlabbatch`。
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